Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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4.5
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2
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7316439--7316518
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133
1.8
133
88
0
376
35
19
17
27
1.94
7348048--7348382
89
3.8
89
82
4
338
34
19
18
27
1.95
7348083--7348380
133
2.2
133
83
2
357
35
19
18
27
1.95
7350022--7350068
3
15.7
3
100
0
94
34
31
0
34
1.58
7353411--7353477
32
2.1
31
97
2
125
34
8
20
35
1.84
7364526--7364577
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
7364441--7365413
120
8.1
120
97
0
1784
44
2
5
47
1.40
7364642--7364692
18
3.0
17
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18
52
47
1
0
50
1.12
7365002--7365052
18
3.0
17
75
18
52
47
1
0
50
1.12
7365632--7365700
16
4.2
16
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129
37
37
0
24
1.56
7365632--7365700
33
2.1
32
97
2
129
37
37
0
24
1.56
7366641--7366681
16
2.5
17
76
19
50
56
0
0
43
0.99
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15
1.9
15
100
0
58
55
0
0
44
0.99
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2
21.5
2
100
0
86
0
48
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7395080--7395167
38
2.3
39
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9
101
32
13
12
40
1.82
7395340--7395441
45
2.3
45
85
0
132
27
23
16
32
1.96
7395673--7395698
8
3.2
8
100
0
52
23
0
34
42
1.54
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16
2.4
14
90
9
52
2
22
0
74
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2.0
17
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5
50
0
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0
72
0.85
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19
1.9
19
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21
2
10
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1.37
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12
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12
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12
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50
0
0
50
1.00
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2
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2
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3
0
46
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3
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100
0
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0
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0
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0
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1.10
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16
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15
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1.70
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3
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0
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0
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0
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30
2.0
30
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0
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26
1
13
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1.45
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23
1.9
23
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9
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45
6
0
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1.29
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6
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6
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0
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0
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1.47
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23
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23
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110
30
15
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22
1.95
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23
6.0
23
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5
123
29
19
32
18
1.96
7431939--7432059
46
2.6
46
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7
156
31
19
32
17
1.95
7432065--7432090
13
2.0
13
100
0
52
30
15
30
23
1.95
7441650--7441764
54
2.1
54
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3
169
50
10
5
33
1.59
7444403--7444437
8
4.4
8
86
13
54
57
0
2
40
1.14
7444672--7444723
13
3.7
13
72
18
50
44
3
3
48
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7444673--7444730
30
1.9
30
100
0
116
44
6
5
43
1.53
7452983--7453051
16
4.1
16
71
14
66
34
20
10
34
1.86
7452969--7453041
36
2.0
36
97
0
137
31
21
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1.83
7454657--7454784
63
2.0
63
100
0
256
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12
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19
2.1
19
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9
55
80
2
12
5
0.98
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2.0
15
93
6
51
37
0
6
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1.27
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15
2.0
15
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6
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37
0
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2.0
21
100
0
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2.2
22
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0
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22
22
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1.97
7486065--7486173
48
2.3
47
81
10
123
35
8
4
51
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          337   338   339   340   341   342   343   344