Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  228  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75578316--75578491
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3.8
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20
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29
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0
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1.98
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0
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1.95
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1.92
75593089--75593157
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3.3
22
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75593082--75593169
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2.7
80
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273
26
27
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1.99
75604534--75604749
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1.8
120
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287
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0
0
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11
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2.0
55
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25
14
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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26
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22
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20
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1.99
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4.6
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1.99
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2.0
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2683
25
8
25
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2.0
47
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167
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2
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10.3
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1.84
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31
21
1.98
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2.3
45
82
8
115
26
20
32
20
1.98
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2.3
81
83
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230
25
28
21
24
1.99
75742318--75742499
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4.6
40
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228
25
28
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
23
32
1.98
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27
2.8
28
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95
21
25
20
32
1.98
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2.1
19
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27
20
24
1.99
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1.9
80
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224
27
27
19
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1.99
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2.2
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27
27
20
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1.99
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27
27
20
24
1.99
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1.9
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26
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26
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75780163--75780346
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234
26
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75802199--75802366
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80
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27
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24
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26
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2
95
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16
6
43
1.74
75817311--75817450
70
2.0
70
100
0
280
25
18
5
50
1.69
75819486--75819567
26
3.2
26
89
0
137
32
6
24
36
1.80
75825777--75825958
46
4.0
46
89
1
249
21
24
14
40
1.90
75828032--75828079
11
4.2
11
79
10
51
62
0
0
37
0.95
75828706--75828968
126
2.1
127
83
0
330
28
17
19
34
1.94
75828835--75829097
140
1.9
140
84
1
357
27
18
21
32
1.97
75830039--75830087
14
3.5
14
81
10
55
22
0
22
55
1.44
75830038--75830099
21
3.0
21
79
9
72
25
0
19
54
1.44
75831627--75831655
15
1.9
15
100
0
58
27
3
20
48
1.66
75833984--75834014
16
1.9
16
93
0
53
22
6
9
61
1.50
75834854--75835007
36
4.2
36
74
8
125
24
19
16
40
1.91
75834854--75835007
73
2.1
73
84
3
195
24
19
16
40
1.91
75834814--75835007
37
5.4
37
75
8
132
26
17
15
41
1.88
75835012--75835084
38
1.9
38
85
0
101
27
20
17
34
1.95
75835357--75835426
30
2.4
29
83
9
81
52
1
4
41
1.30
75835332--75835426
30
3.3
29
80
10
79
55
1
4
38
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75838370--75838405
17
2.2
17
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5
56
47
0
2
50
1.15
75838369--75838406
16
2.4
16
82
8
51
44
0
2
52
1.14
75838749--75838788
19
2.1
19
85
4
53
50
0
0
50
1.00
75842210--75842239
5
6.0
5
100
0
60
20
0
20
60
1.37
75845767--75845863
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2.3
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10
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23
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17
29
1.97
75859215--75859270
21
2.7
21
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25
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0
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2.0
30
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0
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1.84
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2.0
26
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0
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1.84
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6
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0
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0
0
14
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2
0
38
1.10
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2.0
15
100
0
60
60
0
0
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8
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8
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9
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0
0
37
0.96
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15
2.9
15
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0
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27
9
0
62
1.25
75873324--75873402
22
3.5
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70
20
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17
5
5
72
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75877624--75877746
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5.5
22
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20
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1.97
75877639--75877746
45
2.4
45
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146
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1.97
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67
2.0
67
80
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149
32
20
21
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1.98
75887263--75887312
25
2.0
26
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4
93
18
6
0
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22
4.2
22
82
2
89
32
18
24
24
1.97
75894461--75894547
44
2.0
45
88
2
131
32
18
25
24
1.97
75894454--75894555
45
2.3
45
82
3
134
34
16
24
24
1.95
75903282--75903558
96
2.8
96
74
5
261
33
15
20
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75903472--75903626
44
3.5
44
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7
127
32
19
16
31
1.94
75903819--75903948
44
3.0
44
81
0
143
34
18
20
26
1.96
75905390--75905430
21
2.0
21
90
0
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0
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15
2.9
15
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0
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9
0
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8
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9
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0
0
70
0.88
75907320--75907363
3
16.0
3
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29
0
0
70
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3.4
11
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0
0
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0
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1.73
75908189--75908233
10
4.5
10
83
8
56
73
2
8
15
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344