Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  217  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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89
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0
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2.0
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244
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2.2
28
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14
3
14
67
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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78
19
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100
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2.5
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1
45
1.18
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25
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2.0
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2.0
20
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0
0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
33
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21
13
30
1.91
72114695--72115718
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4.7
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1113
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12
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1.91
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2.0
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19
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0
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23
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72130396--72130895
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132
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23
18
30
1.98
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176
2.5
176
94
0
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26
23
18
30
1.98
72131010--72131205
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68
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288
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21
22
27
1.99
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14
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1.95
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285
21
19
22
36
1.95
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132
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131
94
0
521
20
20
22
36
1.95
72131224--72131553
175
1.9
174
87
2
482
21
20
21
36
1.95
72131223--72131599
175
2.2
173
83
4
452
21
21
21
36
1.96
72131598--72131971
134
2.8
134
94
1
649
29
23
19
26
1.98
72131877--72132072
97
2.0
95
95
1
347
29
22
18
29
1.97
72131974--72132385
134
3.1
134
95
0
743
30
23
19
26
1.98
72131743--72132206
231
2.0
229
95
0
838
29
23
19
27
1.98
72131609--72132336
365
2.0
365
97
0
1375
29
23
20
26
1.99
72132878--72133073
108
1.8
108
89
2
313
46
10
17
25
1.80
72133039--72133139
45
2.3
43
80
10
112
52
8
12
25
1.68
72133409--72133459
8
6.6
8
80
15
54
0
9
5
84
0.78
72133408--72133459
13
4.1
13
80
12
63
0
11
5
82
0.82
72133422--72133459
8
4.6
9
90
9
55
0
7
7
84
0.79
72133896--72133991
11
8.5
11
72
20
56
2
8
9
80
0.99
72133901--72133991
8
11.4
8
71
15
55
1
8
9
80
0.97
72133932--72133973
17
2.4
17
92
4
66
2
11
7
78
1.04
72135280--72135462
62
3.0
62
95
0
312
30
7
22
39
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72137696--72137778
3
27.3
3
73
20
59
65
1
3
30
1.17
72137694--72137775
12
6.5
12
76
17
69
64
1
3
30
1.18
72137696--72137778
18
4.6
18
78
14
73
65
1
3
30
1.17
72137694--72137782
27
3.4
27
73
17
80
65
1
3
30
1.16
72138012--72138058
23
2.2
23
85
11
64
55
29
2
12
1.49
72138211--72138237
4
6.8
4
100
0
54
22
0
0
77
0.76
72157941--72157984
23
1.9
23
100
0
88
31
4
25
38
1.76
72157944--72157994
23
2.2
23
85
0
66
37
7
21
33
1.82
72161601--72161694
40
2.4
39
74
13
95
18
12
35
34
1.88
72163468--72163525
30
2.0
29
96
3
107
25
18
24
31
1.98
72172912--72173058
40
3.6
39
82
9
179
23
14
27
34
1.94
72175695--72175727
12
2.8
12
95
0
57
42
12
0
45
1.41
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22
1.9
22
90
0
66
47
0
0
52
1.00
72181613--72181703
9
9.3
9
72
14
56
37
1
1
60
1.11
72181637--72181704
19
3.6
19
75
13
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32
1
1
64
1.11
72181779--72181806
13
2.2
13
100
0
56
21
7
7
64
1.43
72186433--72186608
46
3.8
46
79
12
207
20
20
30
28
1.98
72186430--72186599
93
1.8
93
96
0
313
21
21
29
28
1.98
72203020--72203057
19
2.0
19
100
0
76
42
21
10
26
1.85
72207901--72207958
27
2.1
27
83
0
71
20
31
20
27
1.98
72211129--72211285
78
2.1
76
84
6
201
54
12
5
27
1.59
72213546--72213597
16
3.2
16
94
5
88
61
9
0
28
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72213586--72213933
103
3.3
102
77
15
355
55
15
1
27
1.47
72213807--72213837
7
4.4
7
91
0
53
67
29
0
3
1.06
72213722--72213935
112
1.9
112
86
3
306
54
15
1
28
1.50
72213869--72214007
72
1.9
72
84
4
183
59
12
0
27
1.34
72213949--72213973
12
2.1
12
100
0
50
64
8
0
28
1.22
72213986--72214021
7
5.0
7
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3
54
72
25
0
2
0.98
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21
2.0
21
95
0
73
26
17
29
26
1.97
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3
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1
32
0
66
0.99
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6
100
0
58
86
0
0
13
0.58
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27
2.0
27
82
7
65
44
1
11
42
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344