Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  309  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102010731--102010805
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29
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1.02
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0
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2
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2.4
30
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21
0
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32
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
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56
2
8
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2
8
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1.44
102082071--102082113
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2.2
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84
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69
2
6
20
1.23
102082112--102082164
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11
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5.0
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245
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28
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102084054--102084215
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50
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233
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22
14
37
1.92
102084025--102084215
104
1.9
100
88
7
289
26
21
15
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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20
16
28
1.94
102089836--102090736
380
2.4
380
97
1
1673
34
20
16
28
1.94
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0
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0
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9
208
24
20
24
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
34
1.96
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2.4
21
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2.0
22
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0
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1.55
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23
2.0
24
92
4
80
27
6
27
39
1.80
102140971--102141013
22
1.9
23
85
4
61
58
4
0
37
1.19
102141762--102141839
36
2.2
35
81
2
84
61
5
3
29
1.35
102143001--102143068
30
2.3
30
84
5
84
45
5
19
29
1.73
102149411--102149466
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
102151063--102151203
27
5.2
27
82
14
175
19
24
21
34
1.97
102151060--102151203
54
2.7
54
92
2
227
18
25
22
34
1.96
102151063--102151220
81
2.0
80
84
10
207
20
25
20
34
1.96
102152171--102152270
3
33.3
3
75
9
71
28
6
1
65
1.23
102152464--102152514
18
2.8
18
82
11
59
29
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3
50
1.62
102152503--102152577
3
26.0
3
70
12
50
26
6
4
62
1.38
102152503--102152551
13
3.7
13
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13
55
28
6
2
63
1.30
102152503--102152581
23
3.6
22
78
13
81
26
6
3
63
1.36
102152738--102152913
3
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3
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17
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9
2
59
1.41
102155161--102155291
38
3.4
38
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5
129
25
19
25
29
1.98
102155869--102155915
24
2.0
24
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0
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40
0
21
38
1.53
102161352--102161433
40
2.0
40
100
0
164
28
17
18
36
1.93
102162226--102162303
37
2.1
37
95
0
138
50
12
14
23
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102167921--102168095
46
3.8
46
76
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20
21
29
28
1.98
102167918--102168088
93
1.8
92
90
3
272
21
22
29
27
1.99
102178548--102178612
17
3.8
17
76
6
69
32
21
21
24
1.98
102180854--102180927
25
3.2
25
67
21
79
25
4
14
55
1.57
102180852--102180940
44
2.0
44
100
0
178
24
4
13
57
1.55
102181056--102181184
50
2.5
51
88
2
197
37
17
20
24
1.94
102181162--102181277
31
3.7
31
82
4
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26
18
26
28
1.98
102181295--102181418
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2.7
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2
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27
15
27
29
1.96
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49
2.9
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168
27
14
28
30
1.95
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42
2.7
42
83
4
142
31
13
26
28
1.94
102189428--102189515
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2.0
43
100
0
176
27
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21
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1.87
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19
2.1
19
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0
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25
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52
1.68
102202360--102202401
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8.4
5
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10
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16
2
0
80
0.81
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5
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10
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2
0
80
0.83
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20
1.9
20
84
10
51
39
5
2
52
1.38
102211073--102211118
19
2.4
18
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34
0
2
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1.07
102215438--102215468
11
2.8
11
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0
53
38
6
41
12
1.69
102227821--102227872
26
2.0
26
100
0
104
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15
3
34
1.64
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21
2.7
22
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12
75
19
21
36
22
1.95
102230438--102230492
21
2.6
20
82
8
56
74
16
9
0
1.06
102237673--102237737
22
3.2
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44
10
18
26
1.82
102237689--102237751
18
3.3
18
69
26
58
47
7
22
22
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102237672--102237751
39
2.1
39
100
0
160
46
10
20
23
1.80
102237672--102237734
21
3.1
21
67
28
64
46
11
17
25
1.81
102242297--102242424
52
2.5
52
97
0
238
32
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19
33
1.91
102251344--102251369
3
8.7
3
100
0
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0
0
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0.89
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5.1
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0
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0
16
16
66
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2.0
121
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1
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1.93
102257411--102257464
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2.1
25
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5
52
1.57
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0
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0
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18
2.4
18
88
0
59
20
25
9
44
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344