Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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110
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12
14
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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26
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1
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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30
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0
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0
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0
50
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2416481--2416513
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11
100
0
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62
0
2
34
1.08
2433262--2433383
31
4.0
30
73
14
88
40
6
13
39
1.70
2436035--2436186
40
3.8
39
91
3
225
29
15
3
50
1.62
2436044--2436192
79
1.9
78
87
5
203
30
14
3
51
1.59
2436204--2436242
20
2.0
20
89
0
60
43
10
2
43
1.52
2436624--2436680
22
2.5
23
85
2
71
35
31
3
29
1.75
2440045--2440075
13
2.5
13
94
5
55
74
0
0
25
0.82
2443605--2443639
17
2.1
17
100
0
70
31
0
40
28
1.57
2451514--2451602
41
2.2
41
95
0
160
47
13
11
28
1.77
2455167--2455214
22
2.2
22
88
7
71
66
6
6
20
1.36
2456161--2456780
154
4.0
154
89
4
889
19
7
22
50
1.73
2461416--2461457
18
2.4
17
84
8
57
35
0
0
64
0.94
2463016--2463124
3
36.7
3
74
18
86
63
3
3
29
1.29
2464905--2465611
88
8.1
88
89
3
883
24
24
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2469928--2469967
19
2.0
20
85
4
55
45
10
22
22
1.82
2472092--2472201
3
36.7
3
74
17
86
63
3
3
29
1.28
2474340--2474419
19
4.0
21
69
27
57
41
0
0
58
0.98
2476502--2476526
7
3.6
7
100
0
50
0
16
0
84
0.63
2493553--2493600
22
2.2
22
84
0
60
31
2
20
45
1.63
2493560--2493663
36
2.9
35
75
2
109
32
0
18
48
1.55
2498363--2498409
19
2.5
20
89
6
71
48
6
0
44
1.28
2504025--2504102
32
2.5
32
75
6
79
28
8
12
50
1.71
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11
2.3
11
100
0
50
0
16
0
84
0.63
2515721--2515970
75
3.3
75
94
1
430
18
22
17
41
1.90
2521640--2521689
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
2524484--2524510
3
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3
100
0
54
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0
0
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0.92
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18
2.1
18
100
0
74
29
0
5
64
1.15
2535937--2535968
10
3.4
10
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16
50
28
0
6
65
1.16
2543337--2543482
37
4.0
37
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1
242
25
22
16
35
1.95
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52
5.2
52
87
6
379
27
22
14
35
1.93
2543547--2543719
46
3.7
46
84
9
231
28
22
14
34
1.93
2543446--2543719
98
2.7
98
89
4
388
28
22
14
34
1.93
2549979--2550031
21
2.5
21
81
6
63
33
0
1
64
1.05
2552532--2552563
16
2.0
16
93
0
55
53
9
0
37
1.34
2563372--2563432
30
2.1
30
81
9
72
40
4
13
40
1.65
2573504--2573563
28
2.1
28
87
0
84
31
31
5
31
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2585499--2585525
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
2587314--2587347
17
2.0
17
100
0
68
41
17
5
35
1.74
2589134--2589161
13
2.2
13
100
0
56
60
14
7
17
1.55
2591595--2591636
11
4.0
10
84
9
57
73
0
2
23
0.94
2591603--2591727
9
13.7
9
69
18
55
64
2
2
31
1.19
2591668--2591718
19
2.8
19
73
5
52
60
3
1
33
1.26
2591791--2591836
19
2.4
19
77
0
56
60
0
0
39
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9
5.4
10
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0
0
38
0.96
2591803--2591836
10
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10
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4
50
61
0
0
38
0.96
2591949--2592020
32
2.2
32
80
7
83
38
4
2
54
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344