Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  286  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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18
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Period
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Copy
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Score
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301
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Period
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Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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16
20
31
1.94
96131397--96132177
226
3.5
222
89
3
1169
32
16
20
31
1.94
96131392--96132263
226
3.9
219
86
5
1151
31
16
20
31
1.94
96133875--96133904
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
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22
2.5
23
77
13
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43
0
3
52
1.18
96137683--96137722
20
2.0
20
100
0
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20
20
5
55
1.62
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23
1.9
23
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0
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4
0
40
1.21
96139526--96139569
23
2.0
22
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13
54
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2
0
31
1.05
96139542--96139585
23
2.0
23
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4
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65
0
0
34
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7
3.6
7
100
0
50
28
28
28
16
1.97
96154315--96154395
3
27.0
3
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14
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43
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0
30
1.55
96155462--96155559
38
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37
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56
2
1
40
1.18
96155503--96155535
16
2.1
16
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0
57
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0
0
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39
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39
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0
221
38
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5
31
1.78
96159660--96159695
6
6.0
6
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0
54
16
5
16
61
1.53
96159888--96160141
64
4.0
64
90
1
368
24
14
15
46
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
16
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0
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13
21
51
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38
2.1
38
100
0
156
29
12
12
44
1.80
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100
2.0
100
96
0
371
27
12
13
46
1.79
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15
2.8
15
92
0
75
16
7
38
38
1.76
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43
4.2
43
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2
256
27
8
20
43
1.80
96162213--96162390
83
2.1
85
88
4
263
27
8
20
43
1.80
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21
2.3
21
88
0
69
37
31
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8
1.84
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27
4.3
26
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5
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36
23
23
16
1.94
96163998--96164112
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
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26
4.2
26
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0
193
36
23
5
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1.78
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56
2.0
56
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30
18
10
40
1.85
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30
2.0
30
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49
20
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25
1.69
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3
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3
81
13
54
0
34
2
62
1.08
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26
2.0
26
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7
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1
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1.9
16
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1.91
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0
0
35
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2.0
20
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25
22
5
47
1.71
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9
21.0
9
65
20
77
34
2
3
59
1.28
96191341--96191505
20
8.8
17
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19
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33
1
3
60
1.25
96191341--96191414
38
2.0
38
89
2
114
33
1
1
63
1.11
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21
2.9
22
85
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40
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3
52
1.34
96194446--96194711
93
2.9
92
84
2
318
31
6
16
45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96196520--96196564
22
2.0
22
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0
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40
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0
33
1.57
96207735--96207807
36
2.0
36
97
0
137
26
8
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58
1.52
96211655--96211741
21
4.0
23
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10
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21
14
1.92
96212113--96212170
15
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15
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2
80
53
12
0
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1.38
96213445--96213476
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92
0
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59
0
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37
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22
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0
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9
1
32
1.43
96225908--96225959
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344