Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  39  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13041962--13042023
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2.0
31
100
0
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0
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0
0
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100
0
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13048271--13048312
18
2.3
18
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0
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33
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2.0
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0
128
23
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47
1.78
13066525--13066601
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2.1
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0
100
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14
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100
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18
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37
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34
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13084135--13084403
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0
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20
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1
0
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2.5
21
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5
74
78
1
0
20
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
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0
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22
1.13
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0
0
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100
0
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24
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0
0
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0
0
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2.0
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1.9
19
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0
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34
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0
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16
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9
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3.8
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10
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20
28
29
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1.8
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91
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21
20
29
28
1.98
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3.0
30
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10
17
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3.8
46
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10
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19
29
29
1.98
13152537--13152708
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1.8
93
92
0
290
21
19
30
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13156242--13156452
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4.7
47
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30
1.95
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14
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30
1.95
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2.4
85
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0
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28
14
25
30
1.95
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1.9
14
100
0
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0
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29
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3.2
23
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16
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44
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6
35
1.68
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2.0
51
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90
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18
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2.0
20
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0
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20
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1.74
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2.1
49
98
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16
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43
79
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17
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1.24
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230
24
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25
2.00
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1.91
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54
1
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1.43
13226107--13226162
21
2.8
19
76
10
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57
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13226108--13226157
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32
1.48
13226208--13226244
11
3.0
13
84
15
51
48
8
2
40
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13229297--13229343
23
2.0
23
100
0
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38
17
17
27
1.91
13229803--13229840
15
2.7
14
84
8
51
63
2
0
34
1.09
13231440--13231506
23
3.0
22
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8
64
40
4
4
50
1.43
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12
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53
69
0
12
17
1.19
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20
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25
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0
22
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1.26
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20
2.2
20
95
0
77
37
13
11
37
1.82
13254002--13254053
28
1.9
28
84
7
72
34
1
7
55
1.39
13254301--13254331
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
13254875--13254967
18
5.2
18
90
0
150
27
24
16
31
1.96
13259021--13259051
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
13262265--13262299
4
8.8
4
100
0
70
25
0
22
51
1.48
13263132--13263179
21
2.4
20
79
6
53
33
4
0
62
1.14
13263113--13263194
19
4.1
20
74
12
62
36
2
2
58
1.24
13266320--13266370
26
2.0
25
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7
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52
5
7
33
1.54
13266478--13266515
20
1.9
20
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10
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7
0
26
1.19
13285221--13285333
56
2.0
56
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0
199
25
15
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1.85
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18
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1.87
13290548--13290666
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2.2
54
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1
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29
13
17
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1.88
13298273--13298326
25
2.2
25
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0
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40
14
5
38
1.70
13299576--13299620
20
2.2
20
88
7
65
35
4
26
33
1.77
13307202--13307240
10
3.8
10
83
6
51
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
31
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0
102
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2
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1.61
13320108--13320287
46
3.8
46
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10
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27
17
31
23
1.97
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140
1.8
140
80
3
313
28
17
29
24
1.98
13320160--13320289
47
2.8
47
85
8
160
27
19
30
23
1.98
13320503--13320577
37
2.0
37
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0
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8
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38
1.82
13327065--13327108
15
2.9
15
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12
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11
15
15
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1.66
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46
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22
20
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1.98
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0
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28
28
1.96
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3.0
42
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2
173
30
14
26
29
1.95
13341873--13342047
91
1.9
91
83
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28
14
28
29
1.95
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2.0
15
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0
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50
0
10
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19
1
0
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16
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20
1
0
78
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28
2.6
26
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21
1
0
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0.85
13361979--13362044
22
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0
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0.85
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4.0
26
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0
183
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1.82
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12
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0
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0
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1.24
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189
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3.5
8
100
0
56
25
0
0
75
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3.2
21
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28
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1
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1.25
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21
2.0
20
85
10
53
23
7
0
69
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13376367--13376510
10
14.3
10
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30
4
1
63
1.24
13376387--13376536
9
15.6
9
67
21
56
30
4
2
63
1.26
13376430--13376523
10
9.6
10
70
17
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31
3
1
63
1.17
13376437--13376536
29
3.5
28
77
11
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29
4
1
66
1.17
13376640--13376853
85
2.5
85
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270
35
9
20
34
1.85
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22
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0
0
50
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0
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0
0
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0
3
29
1.06
13382510--13382609
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2.3
44
92
0
173
44
10
5
41
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344