Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  5  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1742663--1742726
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2.1
31
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2
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3
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0
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5
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2.2
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63
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2.0
21
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2
0
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0
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0
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2.0
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2.1
30
100
0
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2.3
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2
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2.2
16
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28
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16
100
0
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57
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18
18
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1858204--1858245
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50
14
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1858204--1858247
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1.9
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2.0
31
83
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3
9
49
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1870981--1871045
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2.1
31
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2.2
30
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2
10
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1872102--1872152
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0
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2.2
22
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0
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2.0
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2.0
51
100
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204
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21
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25
3.2
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2.0
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0
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20
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20
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12
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29
8
2
59
1.40
1911113--1911162
19
2.7
20
81
12
61
28
6
2
64
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1911110--1911194
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2.3
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7
2
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1.37
1911212--1911330
19
6.6
17
69
18
71
30
2
2
64
1.20
1911247--1911330
9
9.6
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26
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1
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2.0
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21
29
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20
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18
1
69
1.25
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4.5
13
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16
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55
1
0
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0
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0
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2
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1.11
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18
2
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1
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1973126--1973192
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0
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1983608--1983650
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2.0
22
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0
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55
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13
16
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1985254--1985293
20
2.0
20
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0
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10
12
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1.72
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1.9
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1997864--1997914
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26
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33
0
33
1.58
2019861--2020109
132
1.9
132
84
4
331
35
19
18
26
1.95
2032758--2032822
33
2.0
33
87
0
94
41
6
6
46
1.54
2038877--2038928
27
2.0
27
84
3
70
46
3
1
48
1.31
2039047--2039102
15
4.1
15
69
21
50
50
10
0
39
1.37
2040665--2040714
25
1.9
26
88
8
75
38
6
0
56
1.24
2042241--2042300
25
2.5
25
94
5
106
40
16
6
36
1.75
2050201--2050547
184
1.9
185
84
4
468
35
19
17
27
1.94
2053630--2053661
16
2.0
16
100
0
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12
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1.65
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54
2.4
51
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6
133
28
15
21
34
1.94
2056246--2056425
54
3.3
55
67
16
142
25
20
21
32
1.98
2056242--2056475
108
2.2
108
92
1
389
25
20
23
30
1.99
2056307--2056473
54
3.1
54
69
13
153
25
22
24
27
2.00
2064008--2064049
22
2.0
21
85
4
57
69
0
2
28
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2066816--2066865
18
2.8
18
79
11
66
40
10
10
40
1.72
2072349--2072384
11
3.2
11
92
4
54
86
8
5
0
0.72
2072883--2072907
10
2.5
10
100
0
50
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0
8
0
0.40
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13
2.0
13
100
0
52
23
0
23
53
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3.9
46
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1
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22
23
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1.90
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62
2.0
62
100
0
254
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4
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42
1.70
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2.1
28
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36
1
1
60
1.17
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3.1
28
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49
0
1
49
1.08
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17
2.2
19
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42
10
0
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1.38
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2.5
17
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3
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0
7
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1.29
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29
2.0
29
100
0
118
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10
3
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28
2.0
29
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3
98
52
1
10
35
1.46
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2.1
32
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2
109
43
10
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29
1.81
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23
2.0
23
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0
74
32
10
10
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1.74
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25
2.0
25
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28
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28
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4
24.2
4
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0
140
22
2
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1.62
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2.9
196
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21
16
28
1.94
2132549--2132598
18
2.7
18
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6
55
10
22
60
8
1.55
2132549--2132583
9
3.9
9
88
0
52
8
20
65
5
1.40
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13
5.5
13
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17
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46
12
0
40
1.41
2135214--2135282
34
2.1
33
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2
93
44
11
0
43
1.40
2139668--2139701
16
2.1
17
88
5
52
23
0
8
67
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2141184--2141231
24
2.0
24
87
0
69
33
37
6
22
1.80
2141193--2141375
57
3.3
57
89
2
255
28
39
8
23
1.83
2141316--2141368
24
2.2
24
89
0
79
24
43
9
22
1.83
2145195--2145293
48
2.1
48
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0
180
29
25
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29
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21
1.9
20
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5
60
58
5
2
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1.33
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2.8
31
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13
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11
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1.73
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7
4.1
7
100
0
58
44
0
0
55
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344