Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  283  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2.3
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3.4
120
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38
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2.5
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2.0
101
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33
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1.9
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53
23
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1.60
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2.8
26
81
4
78
33
21
13
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
2.1
54
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18
23
22
35
1.95
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2.5
43
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16
23
32
1.96
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27
5.9
27
80
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166
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21
23
20
1.97
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2.7
54
91
2
227
34
22
23
19
1.97
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164
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20
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2.6
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1
5
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3
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56
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0
26
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95127396--95127566
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23
1.99
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151
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19
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12
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1.46
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16
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16
100
0
64
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12
6
25
1.59
95141274--95141306
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14
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27
12
0
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1.32
95141609--95141642
10
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9
88
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2
2
41
1.31
95141595--95141658
20
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19
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13
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1
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43
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95144697--95144801
47
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47
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0
174
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95147442--95147482
11
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0
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19
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0
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0
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0
0
31
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2.0
34
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20
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2.0
17
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0
0.79
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6
6.7
6
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0
53
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20
2
0
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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33
2.5
33
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13
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2.0
144
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0
0
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0
0
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54
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16
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36
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3
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20
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0
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0
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11
21
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95228792--95228927
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2.0
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29
2.1
29
84
0
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35
14
9
40
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344