Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  213  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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20
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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6.7
47
75
5
259
29
18
28
23
1.97
70883854--70884182
143
2.3
143
83
5
389
28
17
28
24
1.97
70883915--70884136
95
2.3
96
85
2
277
30
17
28
23
1.97
70883918--70884183
96
2.8
95
82
2
300
29
17
28
24
1.97
70887084--70887120
14
2.6
15
83
12
51
43
8
0
48
1.32
70887135--70887322
61
3.1
61
68
14
181
43
2
5
48
1.39
70887196--70887241
16
2.9
16
78
12
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45
0
2
52
1.13
70887091--70887359
120
2.2
120
93
3
454
42
2
4
49
1.37
70887136--70887319
57
3.1
58
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25
139
42
2
5
48
1.39
70887316--70887357
15
2.7
16
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14
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45
0
2
52
1.13
70887307--70887348
15
2.9
15
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10
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47
0
0
52
1.00
70887483--70887592
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32
1.80
70887573--70887640
16
4.2
16
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0
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35
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0
27
1.58
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40
5.6
40
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3
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29
25
20
23
1.99
70898672--70898893
80
2.8
80
91
2
340
29
26
20
23
1.99
70927429--70927484
1
56.0
1
100
0
112
100
0
0
0
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70929462--70929530
30
2.3
30
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2
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56
17
17
8
1.65
70929473--70929535
15
4.2
15
74
8
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55
15
17
11
1.68
70932465--70932635
46
3.7
45
75
17
154
28
28
21
21
1.98
70932469--70932638
93
1.8
93
88
2
261
28
28
21
21
1.99
70932512--70932655
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3.1
46
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21
113
28
28
20
22
1.99
70940710--70940850
40
3.5
40
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2
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25
26
23
24
2.00
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26
22
27
24
2.00
70944146--70944367
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22
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24
2.00
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26
21
26
24
1.99
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205
26
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1.96
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1.9
81
88
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233
26
15
28
29
1.96
70949536--70949716
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
70954421--70954643
39
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40
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8
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25
22
27
24
2.00
70954421--70954643
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2.8
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282
25
22
27
24
2.00
70954421--70954676
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10
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26
21
27
24
1.99
70956400--70956527
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3.5
37
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210
22
30
21
25
1.99
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39
4.8
38
86
10
202
23
29
21
25
1.99
70964331--70964553
79
2.8
78
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9
265
24
27
22
25
2.00
70964331--70964553
39
5.7
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266
24
27
22
25
2.00
70969015--70969190
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3.8
46
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182
21
21
28
29
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70970989--70971030
20
2.2
20
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0
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28
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70975857--70975933
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2.0
38
89
0
118
27
40
20
11
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70979161--70979283
34
3.6
34
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0
165
20
24
20
34
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70991463--70991541
37
2.2
37
90
2
124
63
3
18
13
1.45
70994414--70994523
23
4.8
23
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34
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22
22
1.97
70994409--70994523
45
2.5
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8
128
34
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22
23
1.96
70996947--70997078
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2.0
65
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0
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1.9
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0
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2.0
46
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0
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71006656--71006703
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3.9
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4
18
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1.70
71015174--71015437
131
2.0
128
97
2
492
25
12
14
46
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344