Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  271  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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23
18
1.95
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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28
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44
12
8
34
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1.39
90890339--90890377
15
2.6
15
95
0
69
46
10
10
33
1.72
90891057--90891118
31
2.0
31
96
0
115
30
25
11
32
1.91
90891720--90892239
125
4.2
125
87
2
677
29
16
15
38
1.90
90891720--90892239
251
2.1
250
86
3
724
29
16
15
38
1.90
90892328--90892402
33
2.3
32
88
9
107
40
10
1
48
1.46
90897836--90897860
11
2.3
11
100
0
50
44
0
0
56
0.99
90900262--90900313
24
2.1
24
85
3
68
48
0
3
48
1.20
90907289--90907354
17
3.9
17
83
15
75
22
1
4
71
1.13
90914787--90915096
40
7.8
40
93
0
521
27
20
28
23
1.99
90916729--90916792
32
2.0
32
90
0
101
34
26
12
26
1.92
90917097--90917163
27
2.5
27
92
0
107
29
17
14
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1.91
90917097--90917176
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27
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30
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17
35
1.93
90928472--90928509
19
2.1
19
90
5
60
28
18
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15
1.92
90928587--90928678
28
3.3
27
80
6
96
27
14
32
26
1.94
90936768--90936931
43
3.8
43
73
13
131
26
16
24
32
1.96
90937559--90937632
34
2.2
34
100
0
148
20
2
29
47
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90943840--90944017
27
6.6
27
82
3
196
26
15
27
29
1.96
90943841--90943996
82
1.9
81
86
3
224
26
16
27
29
1.96
90943837--90944017
82
2.2
81
82
2
220
27
16
27
29
1.96
90950736--90950786
25
2.0
25
85
7
68
29
21
19
29
1.98
90950830--90950864
10
3.4
10
88
7
52
34
17
14
34
1.90
90950825--90950864
21
1.9
21
89
0
62
37
17
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32
1.87
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21
2.5
20
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3
61
37
16
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33
1.85
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31
2.5
31
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0
131
31
18
26
22
1.97
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48
2.9
47
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12
140
22
14
18
44
1.86
90957777--90957824
9
5.6
9
78
9
55
18
10
10
60
1.57
90957779--90957824
17
2.7
17
89
0
74
17
10
10
60
1.57
90957779--90957823
8
5.4
8
79
10
54
15
11
11
62
1.55
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18
3.2
18
75
22
50
31
0
3
65
1.09
90958519--90958570
18
2.8
19
77
8
54
32
0
3
63
1.12
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10
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65
1
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20
1.34
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2.3
16
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0
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16
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1.02
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8
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3
67
8
13
0
78
0.96
90963409--90963592
99
1.9
99
90
0
296
33
25
14
26
1.94
90966136--90966228
25
3.5
26
84
8
84
29
8
3
59
1.43
90966161--90966228
25
2.7
25
86
6
102
32
5
4
57
1.43
90966243--90966488
26
9.5
25
72
16
110
28
4
4
61
1.36
90966238--90966291
24
2.3
24
80
3
65
35
3
3
57
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90966266--90966478
26
8.0
27
71
11
120
28
4
4
62
1.35
90966363--90966404
22
1.9
22
85
0
57
33
7
4
54
1.49
90966362--90966411
22
2.3
22
78
0
55
32
6
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58
1.41
90966400--90966513
50
2.2
52
82
3
151
28
6
3
62
1.36
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47
3.6
47
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2
232
25
28
16
30
1.96
90968273--90968590
93
3.4
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298
22
27
18
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1.97
90968269--90968589
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47
75
9
251
22
28
18
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1.98
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2.2
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0
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2.0
30
83
0
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37
4
24
32
1.77
90983020--90983243
104
2.2
104
93
1
378
17
19
31
31
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344