Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  207  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68638310--68638360
24
2.1
24
96
0
93
56
3
5
33
1.42
68640073--68640199
46
2.7
46
82
2
128
32
24
15
27
1.96
68643647--68643757
55
2.0
55
96
0
204
40
27
6
25
1.79
68655427--68655515
46
1.9
46
83
0
115
33
23
14
28
1.94
68665067--68665182
44
2.6
44
86
8
173
35
19
14
30
1.92
68665184--68665280
50
1.9
50
91
0
158
27
22
19
29
1.98
68665168--68665300
50
2.7
51
75
9
148
27
20
21
30
1.98
68665018--68666032
94
10.9
94
76
9
733
32
18
19
29
1.96
68665382--68665998
44
13.3
43
67
22
206
32
17
21
28
1.96
68665170--68665936
44
16.3
48
67
20
215
31
17
20
30
1.96
68665018--68666032
188
5.4
187
77
9
826
32
18
19
29
1.96
68665687--68665952
50
5.6
49
66
22
145
31
15
23
28
1.95
68666273--68666307
11
3.2
11
88
11
54
82
11
0
5
0.82
68667110--68667167
23
2.5
23
85
2
80
32
3
10
53
1.52
68673159--68673233
3
24.7
3
74
15
57
64
2
5
28
1.29
68675127--68675243
49
2.4
49
85
2
155
28
33
22
16
1.95
68676181--68676369
93
2.0
92
93
1
324
40
11
10
37
1.75
68678112--68678240
27
4.8
28
74
7
90
34
5
3
55
1.41
68678289--68678388
24
4.2
23
71
13
71
32
6
4
58
1.41
68678410--68678474
29
2.3
29
84
7
82
29
10
1
58
1.41
68680577--68680660
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
68684069--68684202
67
2.0
67
95
0
241
38
19
8
34
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68684326--68684372
21
2.2
22
81
11
53
46
10
2
40
1.50
68696579--68696619
20
2.0
20
100
0
82
24
9
29
36
1.87
68698270--68698300
14
2.2
14
100
0
62
38
6
35
19
1.77
68699977--68700081
56
1.9
55
90
2
165
40
20
30
8
1.82
68701048--68701200
42
3.6
42
71
5
135
31
17
21
29
1.96
68700998--68701200
87
2.3
87
85
0
262
32
18
19
29
1.96
68702136--68702169
17
2.0
17
88
0
50
32
0
11
55
1.36
68706075--68706158
26
3.2
26
96
0
150
34
5
23
35
1.80
68707769--68707908
27
5.2
27
85
2
165
18
23
22
35
1.95
68707769--68707906
54
2.5
55
87
4
183
18
23
21
36
1.95
68711244--68711404
3
53.7
3
72
14
118
29
6
2
62
1.33
68711311--68711370
23
2.6
23
83
0
75
33
5
1
60
1.29
68711875--68711926
12
4.0
13
77
7
52
30
1
3
63
1.23
68712331--68712694
127
2.9
127
90
0
532
29
15
16
38
1.89
68716077--68716107
14
2.1
15
94
5
55
19
19
6
54
1.65
68716085--68716136
10
5.4
10
80
17
65
25
21
5
48
1.72
68716083--68716137
19
2.8
20
91
5
87
25
20
5
49
1.70
68716288--68716335
12
4.0
12
81
7
62
37
16
33
12
1.86
68718013--68718262
40
6.3
40
84
3
256
28
26
21
23
1.99
68722020--68722244
80
2.8
80
83
6
287
25
27
21
24
1.99
68722022--68722244
119
1.9
120
82
6
283
25
27
21
25
2.00
68722020--68722244
40
5.6
41
84
7
259
25
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68723373--68723492
56
2.1
56
100
0
240
22
24
9
44
1.82
68728072--68728317
40
6.2
40
84
2
239
29
26
21
22
1.99
68728093--68728321
80
2.9
80
81
5
277
29
27
20
21
1.98
68732806--68732846
18
2.3
18
88
12
59
58
2
36
2
1.24
68737736--68737846
44
2.5
45
79
1
116
28
17
25
28
1.97
68737636--68737979
179
1.9
180
81
5
410
34
16
19
29
1.94
68739620--68739874
3
84.7
3
70
15
107
26
7
4
61
1.42
68739770--68739824
23
2.4
23
84
0
65
32
5
3
58
1.38
68740398--68740453
24
2.3
24
93
0
94
37
12
3
46
1.59
68740775--68741139
127
2.9
127
88
0
532
28
14
17
38
1.89
68741845--68741892
12
4.1
12
83
5
62
43
0
0
56
0.99
68741847--68741892
23
2.0
23
91
0
74
43
0
0
56
0.99
68766252--68766549
41
7.2
41
85
7
356
32
20
26
20
1.97
68766252--68766512
81
3.2
81
87
2
373
32
19
26
21
1.97
68766565--68766695
48
2.7
47
81
8
140
48
29
2
19
1.62
68767542--68767566
6
4.2
6
100
0
50
0
48
0
52
1.00
68770990--68771037
20
2.4
21
82
10
64
25
0
6
68
1.12
68770978--68771037
20
3.1
20
77
13
63
25
0
5
70
1.08
68771143--68771246
43
2.4
43
77
0
118
22
22
26
28
1.99
68787152--68787268
48
2.4
48
89
0
189
19
13
29
37
1.90
68799254--68799444
48
4.0
48
82
5
217
21
17
27
33
1.96
68799254--68799434
96
1.9
96
86
4
258
21
17
25
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68801286--68801351
29
2.3
29
81
0
87
22
22
31
22
1.98
68801337--68801380
17
2.6
17
88
0
70
22
22
25
29
1.99
68808345--68808400
15
3.8
15
76
2
51
35
5
19
39
1.75
68812886--68812928
17
2.6
17
85
3
52
20
0
4
74
1.00
68814288--68814435
43
3.5
43
75
9
133
27
25
20
26
1.99
68821613--68821728
17
6.5
17
82
11
126
38
12
10
37
1.78
68821613--68821728
35
3.2
35
91
3
169
38
12
10
37
1.78
68822134--68823049
207
4.4
207
90
1
1399
30
23
17
29
1.97
68822134--68823049
413
2.2
413
90
0
1458
30
23
17
29
1.97
68823182--68823551
87
4.4
86
81
8
422
23
22
23
30
1.99
68824481--68824548
22
3.2
21
80
15
70
5
10
1
82
0.90
68824487--68824548
21
2.9
21
88
7
81
6
9
1
82
0.91
68830027--68830150
17
6.8
18
86
5
162
37
15
11
36
1.83
68830027--68830142
35
3.2
35
92
3
187
37
14
12
36
1.84
68839409--68839459
18
2.9
17
75
11
50
50
0
3
45
1.20
68845144--68845199
28
1.9
30
85
7
80
26
5
5
62
1.39
68848110--68848155
19
2.4
19
86
13
60
19
19
13
47
1.81
68850092--68850219
37
3.5
37
94
0
211
28
31
17
23
1.97
68850380--68850588
47
4.4
47
91
0
337
25
29
12
32
1.93
68850420--68850587
22
7.2
22
63
26
62
25
29
13
31
1.93
68854569--68854621
6
8.8
6
95
0
97
49
16
33
0
1.47
68854589--68854628
18
2.2
18
86
0
53
60
12
27
0
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68855199--68855223
13
1.9
13
100
0
50
88
0
12
0
0.53
68857115--68857282
46
3.7
45
75
17
175
32
26
17
23
1.97
68857120--68857289
93
1.8
92
92
3
288
31
27
18
22
1.97
68857320--68857367
23
2.0
24
96
4
89
33
27
6
33
1.82
68857729--68857788
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
68865680--68865822
48
3.0
48
89
0
214
34
27
15
21
1.94
68870978--68871016
18
2.2
18
86
9
53
76
0
5
17
0.96
68870920--68871015
11
8.4
11
71
11
59
70
1
5
22
1.13
68882851--68882968
36
2.9
43
78
17
160
35
1
14
48
1.54
68883931--68883956
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
68885188--68885237
18
2.6
20
87
9
77
32
0
38
30
1.58
68886019--68886081
7
8.9
7
73
16
58
52
30
3
14
1.57
68886020--68886081
14
4.4
14
75
18
65
51
30
3
14
1.58
68885999--68886053
21
2.5
22
80
16
62
52
30
0
16
1.44
68886353--68886524
84
2.1
83
87
3
247
31
19
19
29
1.96
68891002--68891039
17
2.3
17
90
4
60
26
0
0
73
0.83
68891006--68891045
21
1.9
21
90
10
64
25
0
0
75
0.81
68891787--68891880
21
4.4
21
68
10
66
14
31
24
28
1.95
68898557--68898643
28
3.1
28
100
0
174
28
31
6
33
1.84
68906505--68906626
47
2.6
47
96
0
217
36
13
25
25
1.92
68906605--68906856
55
4.6
54
86
4
305
35
17
24
22
1.95
68910160--68910199
16
2.3
18
87
8
57
40
25
15
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68910218--68910251
17
2.0
17
88
0
50
47
32
5
14
1.69
68912731--68912816
45
1.9
45
88
4
129
44
37
2
16
1.60
68912726--68912821
23
4.3
23
84
4
133
45
37
2
14
1.57
68913620--68913659
3
14.7
3
80
19
52
25
0
0
75
0.81
68913623--68913661
5
7.4
5
97
2
60
23
0
0
76
0.78
68918082--68918140
3
20.7
3
89
10
97
28
0
0
71
0.87
68919432--68919475
16
2.5
19
82
17
60
40
25
9
25
1.84
68919507--68919540
17
2.0
17
88
0
50
44
32
5
17
1.73
68920434--68920464
16
1.9
16
93
0
53
38
9
0
51
1.35
68921840--68921869
16
1.9
15
93
6
51
40
3
0
56
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344