Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  22  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7711678--7712170
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54
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1.91
7711678--7712170
170
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7
743
38
18
15
28
1.91
7711678--7712170
110
4.5
109
91
6
766
38
18
15
28
1.91
7712149--7712199
14
3.6
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5
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11.3
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14
2.5
14
85
0
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60
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58
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2.5
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9.3
3
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0
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0
0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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86
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212
47
10
21
21
1.79
7734129--7734402
140
2.0
138
83
7
349
32
22
18
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1.97
7735042--7735071
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3
100
0
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0
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2.5
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14
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1
1
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2.9
25
84
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96
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15
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0
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0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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88
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2.0
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20
25
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2
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1
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58
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26
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141
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5
25
35
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7840572--7840858
137
2.1
137
98
0
547
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19
24
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1.98
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15
81
28
20
27
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1.99
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0
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15
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16
2.4
16
91
4
60
39
7
0
52
1.31
7858677--7858717
21
2.0
21
85
0
55
17
24
19
39
1.92
7863978--7864085
15
7.2
15
69
12
87
43
7
23
25
1.79
7863971--7864085
30
3.8
30
97
0
203
44
6
23
25
1.78
7868667--7868774
15
7.2
15
69
12
87
43
7
23
25
1.79
7868660--7868774
30
3.8
30
97
0
203
44
6
23
25
1.78
7872787--7872819
2
16.5
2
93
0
57
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3
0
48
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15
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17
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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21
2.4
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0
2
58
1.10
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2.0
25
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2
2
34
1.19
7896529--7896645
16
6.9
17
72
19
59
57
1
4
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7896508--7896639
64
2.1
64
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11
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2
4
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1.33
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3
13.0
3
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0
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0
2
30
1.05
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6
5.5
6
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6
50
52
11
2
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1.53
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11
3.1
12
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12
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48
0
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0
1.00
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26
16
27
1.97
7898632--7899144
132
3.9
132
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0
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1.97
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1.99
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134
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22
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1.99
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27
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1.97
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6.0
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95
0
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22
20
29
1.99
7899660--7900234
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190
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26
22
20
29
1.99
7899660--7900234
284
2.0
286
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1010
26
22
20
29
1.99
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2.1
134
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22
20
27
1.99
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2.1
46
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25
1.98
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22
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42
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23
23
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26
2.00
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6
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13
1
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7
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15
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3
13
1
81
0.88
7901933--7901990
13
4.4
14
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12
61
3
12
1
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3.0
62
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0
323
33
4
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41
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265
2.0
266
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0
1001
23
25
18
32
1.97
7906754--7906870
16
6.9
17
72
19
59
57
1
4
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7907068--7907103
3
12.0
3
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0
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0
2
30
1.06
7907217--7907250
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5.5
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2
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3.0
11
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45
0
54
0
0.99
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2.6
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19
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7935237--7935276
18
2.3
17
87
12
55
15
17
5
62
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344