Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Copy
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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43
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253
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1.98
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17
14
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19146855--19147204
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1.95
19150107--19151058
472
2.0
472
98
0
1850
25
23
17
33
1.96
19164140--19164180
20
2.0
20
100
0
82
29
14
9
46
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19168249--19168282
11
3.0
11
91
4
50
35
5
0
58
1.22
19172735--19173054
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7.0
46
90
0
444
21
23
13
41
1.89
19172957--19173032
25
3.2
25
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21
63
23
22
11
42
1.87
19172982--19173053
21
3.2
21
65
14
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26
23
9
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1.85
19174437--19174483
11
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15
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12
31
0
55
1.38
19174879--19174912
8
4.5
8
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14
54
76
0
0
23
0.79
19174871--19174912
14
3.0
13
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13
57
76
0
0
23
0.79
19174911--19174950
20
2.1
18
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9
53
45
7
0
47
1.31
19182613--19182667
28
2.0
28
100
0
110
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19186268--19186300
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0
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30
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21
15
1.94
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6
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6
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0
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50
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25
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25
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0
104
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28
3
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19225206--19225238
7
4.9
7
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7
59
12
0
0
87
0.53
19225206--19225238
13
2.4
14
95
5
59
12
0
0
87
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19233325--19233377
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2.5
22
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6
65
15
33
35
15
1.88
19235944--19236015
32
2.3
31
81
9
76
52
12
13
20
1.73
19235955--19236015
32
1.9
32
83
6
79
47
13
14
24
1.80
19241414--19241599
40
4.7
40
89
4
243
26
27
22
23
1.99
19241414--19241599
80
2.3
81
87
3
270
26
27
22
23
1.99
19262186--19262217
17
1.9
17
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6
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18
6
18
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1.62
19272759--19272879
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10
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24
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1.99
19273215--19273412
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0
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1.91
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1.97
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2.0
31
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0
115
20
22
22
33
1.97
19294702--19294748
25
2.0
25
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27
14
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4.7
46
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1
283
20
25
15
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84
4.0
90
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427
21
24
16
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1.93
19295188--19295347
38
4.0
38
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12
221
23
24
18
34
1.96
19295099--19295347
130
2.0
122
88
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372
22
24
17
34
1.95
19297486--19297568
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2.7
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2.1
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123
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26
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29
1.95
19302683--19302728
22
2.1
22
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47
28
0
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1.52
19309355--19309410
15
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15
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0
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17
1
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33
1.59
19311868--19312010
12
12.1
12
66
27
58
34
4
0
60
1.23
19311879--19311988
20
5.5
21
73
21
76
35
5
0
59
1.21
19311868--19311988
13
9.1
13
69
24
58
34
4
0
60
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19311896--19312016
18
6.3
18
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24
72
32
4
0
61
1.23
19314860--19315064
40
5.1
40
85
4
236
25
27
21
24
1.99
19322919--19323050
40
3.3
40
93
4
223
27
28
20
24
1.99
19330617--19330801
79
2.3
82
83
7
238
26
27
22
23
1.99
19330598--19330801
40
5.1
40
83
8
238
25
27
22
24
2.00
19344147--19344455
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47
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28
29
1.88
19345881--19345983
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2.4
43
100
0
206
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1.94
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29
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247
23
21
27
26
1.99
19346386--19346594
80
2.6
79
82
6
244
24
20
27
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344