Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  302  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100131844--100131898
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28
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1.31
100132722--100132772
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4.3
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11
61
31
1
5
60
1.31
100132868--100132904
12
3.0
13
88
7
51
21
8
0
70
1.13
100132958--100133006
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144
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1.97
100136543--100136895
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144
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2.2
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2
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1.31
100160290--100160339
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2.2
22
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2
4
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19
23
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2.1
12
100
0
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20
24
16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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14
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1.91
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22
22
25
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1.99
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2.6
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22
26
30
1.99
100179962--100180200
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2.1
116
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320
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22
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1.99
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28
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90
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2.4
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0
123
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13
25
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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5
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19
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1
63
1.31
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4.5
15
78
14
68
29
7
0
62
1.22
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2.5
44
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1.31
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2.0
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2
6
47
1.40
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1.9
241
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55
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1.92
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24
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100223177--100223240
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1.50
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17
59
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0
2
21
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100237825--100237891
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8.7
7
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18
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76
0
2
20
0.92
100237825--100237891
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4.3
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66
76
0
2
20
0.92
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1.9
17
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9
3
37
1.51
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0
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1.97
100245557--100245814
3
85.3
3
69
15
131
28
9
1
60
1.37
100245621--100245692
32
2.2
32
77
15
78
29
9
1
59
1.38
100245785--100245821
17
2.2
17
95
0
65
29
5
2
62
1.31
100266715--100266759
23
2.0
23
90
0
72
53
11
2
33
1.49
100266820--100266877
29
2.0
30
86
3
82
39
15
12
32
1.84
100266836--100266902
31
2.3
27
78
14
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11
10
35
1.76
100266971--100267116
63
2.3
62
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5
168
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8
36
1.58
100269278--100269406
47
2.7
47
86
1
159
31
30
17
21
1.96
100274269--100274308
21
2.0
21
85
5
55
32
10
10
47
1.70
100277217--100277284
35
1.9
36
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8
95
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5
4
27
1.38
100277369--100277474
41
2.6
41
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10
128
63
1
1
33
1.16
100279009--100279599
119
5.0
119
93
0
1006
30
18
17
33
1.94
100279009--100279599
237
2.5
237
94
0
1004
30
18
17
33
1.94
100304248--100304295
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2.0
24
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0
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20
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1.81
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121
1.9
120
88
4
344
39
10
19
29
1.86
100319943--100319982
17
2.3
18
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4
73
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10
0
45
1.37
100320330--100320432
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5
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0
13
44
1.44
100320334--100320440
33
3.2
34
81
5
128
39
0
14
45
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100320350--100320456
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3.4
31
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10
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44
0
10
43
1.44
100320542--100320933
126
3.1
124
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3
518
38
15
16
29
1.90
100324633--100324676
19
2.3
19
85
14
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45
6
0
47
1.29
100327331--100327461
46
2.8
45
85
9
156
32
10
6
51
1.61
100332960--100333134
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3.8
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7
210
27
29
21
21
1.99
100332968--100333139
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1.8
93
92
0
290
26
29
22
21
1.99
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46
3.1
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15
123
28
29
20
21
1.98
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3.0
30
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15
10
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4
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60
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16
10
1.59
100335509--100335597
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58
15
15
10
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21
1.98
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29
28
20
21
1.98
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25
27
21
25
1.99
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1.99
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2.4
26
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27
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4
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20
19
24
1.96
100360515--100360737
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4.1
54
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0
311
35
21
18
24
1.96
100360515--100360734
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2.7
81
85
1
298
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20
18
25
1.95
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2.3
15
100
0
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26
20
35
17
1.95
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1.9
17
100
0
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30
0
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74
10
190
23
29
19
27
1.98
100376637--100376790
74
2.1
76
85
7
208
24
21
25
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100376637--100376790
38
4.1
38
84
6
181
24
21
25
28
1.99
100397273--100397318
23
2.0
23
100
0
92
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21
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39
1.84
100401821--100402045
122
1.9
120
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3
344
39
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20
29
1.86
100412921--100412960
17
2.3
18
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4
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10
0
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100413311--100413418
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130
39
0
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1.45
100413327--100413434
34
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31
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9
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45
0
10
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124
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19
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6
0
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24
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68
1
0
29
1.00
100418293--100418344
25
2.1
25
79
13
63
69
1
0
28
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344