Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  244  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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374
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2.6
26
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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21
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0
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1.30
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2
0
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1.12
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2.6
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60
1
0
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81081285--81081375
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4.1
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54
2
0
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3.8
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3.5
35
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0
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11
23
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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2.2
119
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25
21
28
24
1.99
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40
5.7
40
85
5
287
24
21
28
25
1.99
81101623--81101880
119
2.2
119
80
6
274
25
21
28
24
1.99
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3.2
35
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2
152
26
10
25
37
1.88
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1.87
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96
93
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673
29
30
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1.87
81111125--81111530
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15
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35
1.86
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5
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0
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0
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0
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14
32
1.93
81136579--81136603
13
1.9
13
100
0
50
28
24
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
81138921--81138997
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1
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5
75
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5.7
6
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14
50
0
15
0
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11
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11
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1
18
4
76
1.03
81138921--81138997
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14
59
1
18
5
75
1.06
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5
12.2
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20
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36
3
18
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12
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12
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3
16
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1.65
81140118--81140175
17
3.5
17
76
2
64
36
3
15
44
1.63
81150968--81151027
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1.9
32
83
10
79
48
1
1
48
1.21
81151261--81151319
26
2.2
27
85
8
77
57
0
3
38
1.15
81151267--81151318
18
2.9
17
80
8
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55
0
3
40
1.18
81153664--81153694
6
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6
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4
53
0
16
19
64
1.29
81155941--81156015
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2.3
33
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2
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54
1
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37
1.35
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4
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0
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81161867--81161914
20
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81174702--81174828
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2.0
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81176265--81176537
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1
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20
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81176265--81176527
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1.9
137
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1.89
81176465--81176536
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1.87
81176265--81176537
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1
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1.89
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48
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48
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1.96
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23
27
19
29
1.98
81181508--81181677
93
1.8
92
85
8
238
22
26
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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20
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2.0
42
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0
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1.60
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2.2
18
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30
2
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20
3.2
20
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20
29
29
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1.98
81195822--81195911
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2.2
41
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2
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30
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1.97
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0
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0
0
18
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0
0
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0
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67
1
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1.23
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16
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2.1
28
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0
10
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1.31
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28
2.2
26
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15
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5
5
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1.46
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13
2.1
13
100
0
54
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26
5.5
26
92
0
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33
6
24
35
1.82
81222020--81222163
52
2.8
52
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0
279
33
6
24
35
1.82
81222647--81222754
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81224353--81224493
27
5.2
27
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11
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19
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21
35
1.96
81224350--81224493
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2.7
54
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2
218
18
23
22
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1.96
81235036--81235065
3
10.0
3
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0
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0
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2.4
25
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0
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26
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2.1
25
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7
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2.4
44
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0
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21
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89
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25
23
22
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1.99
81247932--81248056
65
1.9
65
83
0
160
52
10
18
19
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344