Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  306  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101134154--101134201
16
2.7
19
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16
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101134235--101134288
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3
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3
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0
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0
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2.1
17
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0
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0
2
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1.14
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4.5
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81
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1
4
58
1.24
101135133--101135229
38
2.3
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80
16
101
36
1
4
58
1.24
101135185--101135256
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2.0
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2
110
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4
5
55
1.42
101135219--101135297
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3.3
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10
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36
2
5
55
1.35
101135175--101135297
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22
69
35
2
4
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1.34
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4.4
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3
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2.3
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20
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28
28
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2.0
104
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0
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1.9
19
88
0
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56
0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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13
25
33
1.94
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24
1.9
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2.2
144
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1.97
101158401--101158715
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5
300
23
27
17
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1.97
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1.9
21
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0
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2
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2.0
24
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13
41
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101177901--101177962
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16
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2.0
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0
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5
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2.0
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22
2.2
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2.0
52
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2.0
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100
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0
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53
0
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1.13
101227276--101227316
21
2.0
21
85
0
55
24
4
7
63
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1
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2.4
22
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11
72
62
5
3
27
1.34
101240152--101240332
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3.4
54
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4
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18
13
28
1.89
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86
3.7
84
82
11
374
37
19
16
25
1.92
101240280--101240592
173
1.8
171
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438
37
19
16
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1.93
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2.4
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5
3
27
1.34
101253160--101253226
31
2.2
31
86
10
93
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5
1
35
1.33
101253160--101253252
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3.1
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15
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4
2
37
1.31
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2.1
30
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2.0
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30
23
13
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1.93
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46
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1
49
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101290696--101290760
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19
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35
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1.32
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37
0
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30
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1.9
116
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44
11
15
28
1.81
101293168--101293416
116
2.1
117
82
4
281
46
11
14
27
1.79
101294375--101294408
18
1.9
18
88
5
52
58
8
0
32
1.29
101305008--101305076
27
2.6
27
90
2
104
28
20
20
30
1.97
101305025--101305083
27
2.2
27
93
0
100
30
20
15
33
1.93
101306333--101306359
10
2.7
10
100
0
54
62
0
7
29
1.22
101317602--101317677
29
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28
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12
73
56
3
0
39
1.18
101320876--101320958
21
3.9
21
80
3
76
38
26
20
14
1.91
101320874--101320948
21
3.5
22
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9
91
40
26
20
13
1.89
101321333--101321389
15
3.9
15
90
2
89
50
12
0
36
1.40
101322660--101322701
5
8.4
5
100
0
84
59
0
0
40
0.97
101322724--101322760
8
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0
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0
0
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33
2.2
33
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0
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13
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21
21
1.88
101337716--101337742
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0
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1.79
101340082--101340121
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2.1
19
100
0
80
32
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1.91
101340380--101340410
14
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0
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0
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0
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1.9
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0
61
61
0
0
38
0.96
101352949--101353065
28
4.3
27
86
7
155
33
21
23
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101352949--101353064
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2.1
54
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171
33
20
23
22
1.97
101359674--101359701
6
4.7
6
100
0
56
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28
0
17
1.44
101359662--101359701
18
2.2
18
86
0
53
55
22
0
22
1.44
101361077--101361391
33
9.5
33
79
5
244
32
3
40
23
1.72
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2.5
98
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2
285
32
2
41
24
1.68
101361084--101361421
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5.1
66
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5
335
32
3
41
22
1.72
101361418--101361507
33
2.7
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13
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3
50
21
1.64
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1.9
30
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0
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38
1.81
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207
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28
1.36
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20
2.5
20
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6
55
61
6
2
30
1.32
101369018--101369319
3
100.0
3
71
14
142
28
6
3
61
1.36
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23
2.3
23
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0
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30
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1
59
1.36
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19
1.9
19
94
0
65
21
8
2
67
1.29
101369438--101369518
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2.2
36
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14
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24
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3
59
1.49
101369527--101369624
34
2.9
34
72
4
81
29
9
2
59
1.40
101374119--101374253
60
2.2
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8
148
26
25
20
28
1.99
101374258--101374301
19
2.2
20
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4
54
34
20
18
27
1.96
101375554--101375591
19
2.1
19
85
9
53
73
0
15
10
1.09
101377727--101377813
30
2.9
30
98
0
165
17
51
6
24
1.69
101378312--101378371
18
3.2
18
76
17
59
33
5
1
60
1.29
101378445--101378490
12
3.7
13
80
13
53
30
0
6
63
1.20
101378529--101378579
3
17.0
3
84
8
68
35
3
0
60
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101380635--101380680
19
2.4
19
85
7
58
19
17
13
50
1.78
101388806--101389589
87
9.1
87
84
2
972
34
22
22
20
1.97
101388812--101389579
86
8.9
86
81
5
843
34
22
22
20
1.97
101388809--101389589
173
4.5
173
86
2
1014
34
22
22
20
1.97
101390100--101390179
30
2.7
30
98
0
151
15
52
7
25
1.68
101390679--101390763
3
27.7
3
77
17
79
30
3
1
64
1.17
101390679--101390763
36
2.4
35
84
13
104
30
3
1
64
1.17
101390845--101390900
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18.0
3
82
14
53
32
0
5
62
1.18
101390699--101390863
89
1.9
89
81
7
201
30
8
2
58
1.40
101390845--101390900
12
4.7
13
77
16
59
32
0
5
62
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344