Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  277  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92956638--92956692
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0
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0
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66
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2.6
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0
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22
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2.0
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0
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40
3.6
40
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7
195
24
23
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93054362--93054571
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22
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26
2.00
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2.7
47
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26
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85
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0
0
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1.87
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5.8
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33
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28
29
1.87
93102545--93103096
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145
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922
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29
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2.8
37
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3.3
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0
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28
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2.0
32
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101
20
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1.93
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18
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18
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1
2
62
1.16
93114788--93114912
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3.3
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105
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1
1
61
1.15
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21
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32
3
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93114867--93114925
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2.6
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3
1
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1.21
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23
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31
2
1
64
1.18
93114803--93114927
62
2.1
56
84
12
153
32
2
1
63
1.17
93114829--93114980
16
9.9
14
69
19
56
30
3
1
63
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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4
4
58
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21
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33
3
1
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1.18
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25
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32
2
1
63
1.16
93126456--93126516
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2.5
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32
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1
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1.21
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2.0
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18
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1.31
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2.1
27
84
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73
34
3
20
41
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93184625--93184685
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2.2
28
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113
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6
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1.79
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21
2.7
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10
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22
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28
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1.97
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60
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15
0
36
1.46
93208770--93208820
24
2.2
23
85
3
66
78
3
1
15
0.99
93216129--93216173
22
2.0
23
83
12
58
31
0
4
64
1.13
93217826--93217877
9
5.6
9
81
4
50
61
1
0
36
1.07
93217846--93217880
19
1.9
19
88
11
56
57
2
0
40
1.14
93217939--93217981
21
2.0
21
81
0
50
27
4
4
62
1.35
93219686--93219711
13
2.0
13
100
0
52
23
7
23
46
1.78
93227866--93227926
21
3.0
19
77
13
59
67
3
1
27
1.16
93229142--93229810
174
3.8
175
91
1
1053
25
19
20
33
1.97
93229121--93229851
173
4.2
173
89
2
1017
25
19
21
33
1.97
93229192--93229847
86
7.6
84
65
19
296
25
19
21
33
1.97
93229134--93229825
349
2.0
346
88
3
980
26
19
20
33
1.97
93230739--93230814
39
1.9
39
94
0
134
25
19
10
44
1.82
93235694--93235750
28
2.0
28
100
0
114
14
17
24
43
1.86
93237936--93237968
14
2.2
16
89
10
52
45
12
21
21
1.84
93242433--93242494
20
3.0
19
73
17
52
67
3
1
27
1.15
93243672--93243760
38
2.3
38
86
7
119
35
16
16
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93245867--93245936
32
2.2
32
97
0
131
31
15
7
45
1.73
93246829--93246879
25
2.0
25
84
0
66
15
7
15
60
1.56
93248814--93248850
14
2.6
15
87
8
51
32
10
2
54
1.49
93248815--93248861
14
3.4
15
81
18
50
25
10
4
59
1.49
93249703--93249801
50
2.0
50
89
0
153
31
5
16
47
1.68
93253339--93253399
30
2.0
30
83
0
77
21
32
27
18
1.96
93253768--93253806
13
3.1
12
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10
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17
7
10
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1.48
93254486--93254528
11
4.0
11
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16
2
4
76
1.05
93255787--93255887
50
2.0
52
82
5
125
60
3
7
27
1.43
93255862--93255904
18
2.4
18
84
0
59
55
2
11
30
1.48
93255928--93255987
25
2.4
24
76
18
59
56
6
5
31
1.47
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3
11.7
3
100
0
70
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0
0
34
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30
1.9
30
92
0
96
17
31
38
12
1.87
93260574--93260990
199
2.1
199
94
0
726
24
23
31
19
1.98
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9
4.6
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83
16
59
26
0
0
73
0.83
93261196--93261236
20
2.1
19
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4
73
26
0
0
73
0.84
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2.6
11
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5
51
26
0
0
73
0.84
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14
2.2
14
94
0
53
25
0
0
74
0.82
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10
3.0
10
90
0
51
70
6
10
13
1.34
93262348--93262386
20
2.0
20
89
0
60
76
5
7
10
1.13
93268977--93269035
26
2.2
27
81
6
66
71
1
1
25
1.05
93268974--93269044
37
1.9
37
86
11
101
71
1
1
25
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93268974--93269044
18
3.8
19
80
14
78
71
1
1
25
1.02
93289692--93289728
18
2.1
18
100
0
74
48
5
10
35
1.61
93293966--93294115
43
3.5
43
93
0
237
12
22
32
33
1.90
93293945--93294114
86
2.0
84
87
2
241
12
21
32
32
1.91
93296501--93296577
38
2.0
38
100
0
154
40
10
15
33
1.81
93297296--93297470
46
3.8
46
78
13
196
28
28
21
21
1.99
93297303--93297474
93
1.8
93
93
0
299
27
28
22
21
1.99
93304846--93305015
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1.8
93
94
0
304
28
28
21
21
1.99
93304837--93305012
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3.8
46
78
12
198
29
28
20
21
1.98
93304888--93305031
46
3.1
44
76
15
141
29
28
20
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344