Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  205  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68155479--68155512
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2.4
14
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5
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0
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1.38
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0
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2.1
15
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0
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28
6
0
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1.16
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1.8
105
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28
1.94
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1.9
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1
288
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68159824--68160492
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14.5
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11
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19
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0
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2.0
236
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2.2
38
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51
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21
28
28
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93
91
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21
28
28
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2.0
254
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0
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14.3
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17
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2
1
19
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1
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0.90
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1
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10
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23
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0
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19
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25
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22
2.0
26
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2
4
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1.26
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178
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19
2.5
19
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53
61
0
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36
1.08
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20
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56
2
2
38
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3
2
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2
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3
2
65
1.19
68247660--68247783
57
2.2
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173
29
6
2
61
1.34
68247681--68247778
29
3.4
29
78
10
112
32
6
2
59
1.34
68247698--68247785
28
3.1
28
80
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115
31
3
1
63
1.18
68247660--68247795
28
4.7
27
69
14
85
28
5
2
62
1.33
68247707--68247796
19
4.7
20
73
10
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27
3
2
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1.19
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2.0
27
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0
0
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92
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524
36
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33
1.84
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2.7
19
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11
70
60
1
1
35
1.19
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21
2.1
21
84
8
56
26
8
4
60
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68250196--68250246
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1
0
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1.05
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5
2
61
1.31
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27
3.3
27
74
14
87
32
5
3
58
1.37
68250261--68250343
27
3.0
27
74
13
71
31
4
0
63
1.15
68250207--68250326
35
3.4
35
72
15
88
29
5
1
64
1.24
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18
4.9
18
77
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69
33
4
0
61
1.16
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27
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1
2
55
1.24
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1.81
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19
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1.81
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230
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1.92
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1.92
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15
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1.93
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24
2.4
25
88
2
91
79
12
1
6
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68264912--68264976
28
2.3
28
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2
85
60
32
4
3
1.33
68264923--68264989
31
2.3
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91
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38
4
4
1.42
68266778--68266823
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2.3
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11
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0
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0
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0
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51
25
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1
64
1.31
68274718--68274763
3
15.3
3
83
0
56
34
4
2
58
1.30
68285898--68286881
44
21.8
44
69
9
459
31
18
21
28
1.97
68285896--68286160
92
2.9
90
78
4
302
31
20
21
26
1.98
68286125--68286468
89
3.8
89
74
5
287
29
18
22
29
1.97
68285943--68286381
226
2.0
224
87
1
637
30
18
22
28
1.97
68286028--68286516
226
2.2
226
80
2
527
30
18
21
29
1.97
68286399--68286885
229
2.1
225
79
6
502
32
17
20
28
1.96
68286497--68286748
140
1.8
140
81
1
317
33
16
21
28
1.95
68289410--68289467
30
1.9
30
85
0
80
18
39
29
12
1.87
68293786--68293845
25
2.4
25
83
8
77
23
26
15
35
1.94
68293791--68293859
25
2.8
25
80
10
61
26
26
20
27
1.99
68296224--68296289
29
2.3
29
94
0
114
57
6
18
18
1.60
68296234--68296297
29
2.2
29
88
0
92
57
4
15
21
1.56
68303131--68303237
3
35.7
3
74
5
83
64
3
5
26
1.32
68303131--68303236
18
5.7
18
76
6
95
65
3
5
25
1.32
68316530--68316574
12
4.0
11
86
11
56
20
2
2
75
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68317664--68317701
19
2.1
19
90
9
62
73
7
5
13
1.22
68317716--68317829
3
39.0
3
69
8
56
54
1
9
34
1.44
68318163--68318242
21
4.0
21
75
14
78
57
5
3
33
1.38
68318169--68318242
19
3.7
19
80
8
85
58
5
2
33
1.35
68321305--68321525
40
5.6
40
85
5
261
24
21
28
24
1.99
68329351--68329575
40
5.7
40
84
5
269
24
21
28
25
1.99
68337609--68337634
13
2.0
13
100
0
52
23
0
0
76
0.78
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4.1
8
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50
24
0
0
75
0.80
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16
2.3
15
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4
54
13
11
0
75
1.06
68339435--68339488
13
4.2
12
76
9
54
12
1
9
75
1.11
68339436--68339488
19
2.7
19
82
8
63
13
1
9
75
1.12
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10
2.5
10
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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26
2.2
26
100
0
112
28
30
17
23
1.97
68346803--68346917
40
2.9
40
83
7
144
26
27
21
24
1.99
68349480--68349524
14
3.3
14
84
3
56
15
44
17
22
1.86
68349717--68349792
36
2.1
36
90
4
118
34
19
15
30
1.93
68351658--68351691
13
2.8
12
86
8
50
35
2
0
61
1.11
68353669--68353766
7
13.9
7
79
13
60
30
1
3
65
1.15
68353739--68353802
3
20.0
3
76
17
58
34
1
1
62
1.14
68353720--68353768
7
7.1
7
88
4
64
38
0
0
61
0.96
68353717--68353802
17
5.1
17
75
16
65
33
1
1
63
1.09
68354117--68354174
26
2.2
27
82
14
77
29
8
0
62
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68354419--68354461
16
2.7
16
79
13
52
27
9
4
58
1.49
68371219--68371249
15
2.1
15
100
0
62
19
12
12
54
1.70
68372420--68372454
17
2.1
17
88
0
52
45
0
0
54
0.99
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16
2.1
16
88
11
50
59
18
0
21
1.38
68381834--68382149
146
2.1
148
84
6
408
32
20
15
31
1.94
68381834--68382149
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4.2
74
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5
406
32
20
15
31
1.94
68382103--68382198
49
2.0
49
95
0
174
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21
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1.96
68382152--68382292
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2.0
72
97
0
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19
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1.93
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5
135
38
20
14
26
1.91
68382424--68382457
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          337   338   339   340   341   342   343   344