Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  58  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18746994--18747070
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4
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1.33
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100
0
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24
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2.0
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2
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2.2
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14
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5
22
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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5.0
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40
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18
18
21
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21
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20
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2.00
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2
110
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25
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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11
11
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16
19
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2.4
234
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1.94
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15
18
36
1.92
18894569--18894737
74
2.3
74
88
4
252
31
17
17
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18896917--18896999
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3
69
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52
31
2
1
65
1.13
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24
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12
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12
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1
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26
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26
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0
104
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19
38
1.80
18916098--18916152
27
2.0
28
89
3
85
40
10
27
21
1.87
18925005--18925176
46
3.7
46
79
10
206
22
21
27
29
1.99
18925002--18925172
93
1.8
93
93
0
297
22
21
28
28
1.99
18939135--18939338
53
3.8
53
79
3
210
36
17
23
22
1.94
18947305--18947392
42
2.0
44
91
4
144
21
21
27
29
1.99
18948696--18948814
63
1.9
63
92
0
202
29
17
16
36
1.92
18950315--18950352
15
2.6
15
84
16
53
15
0
39
44
1.47
18950315--18950396
7
11.6
7
74
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51
17
0
39
43
1.49
18956227--18956273
24
2.0
24
95
0
85
23
4
21
51
1.65
18956407--18956450
22
1.9
22
86
9
61
56
4
0
38
1.20
18956462--18956713
43
5.9
43
77
6
219
25
15
28
30
1.96
18956462--18956698
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2.8
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7
260
24
14
29
30
1.95
18956632--18956725
43
2.2
42
84
1
116
21
19
29
29
1.97
18956567--18956731
85
2.0
83
80
4
188
23
18
28
30
1.97
18962530--18962737
107
1.9
107
89
0
317
31
20
18
29
1.96
18963006--18963051
21
2.2
21
96
3
85
28
4
0
67
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18963276--18963327
23
2.2
25
83
13
65
23
1
7
67
1.27
18964874--18965056
63
2.9
62
90
3
276
30
17
17
34
1.93
18969171--18969199
3
9.7
3
100
0
58
65
0
0
34
0.93
18969323--18969358
18
2.0
18
89
10
56
55
5
8
30
1.52
18970150--18970199
14
3.5
14
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5
55
14
4
14
68
1.36
18970149--18970203
15
3.7
15
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4
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12
5
14
67
1.40
18970417--18970516
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3.4
29
78
12
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41
3
22
34
1.69
18970430--18970516
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2.9
30
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1
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3
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1.71
18970978--18971013
14
2.7
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5
13
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1.67
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1.8
88
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35
19
17
27
1.94
18971033--18971229
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2.5
79
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5
229
33
18
16
30
1.94
18970870--18971405
246
2.2
241
83
5
630
34
19
17
29
1.94
18971330--18971681
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5.0
67
79
12
305
31
18
16
34
1.93
18971406--18971687
72
3.8
72
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2
420
32
17
15
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1.92
18971248--18971687
144
3.0
144
80
7
507
31
18
17
32
1.94
18991247--18991280
9
3.8
9
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0
50
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2
26
1.30
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22
2.2
22
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7
60
58
0
4
36
1.18
18991501--18991652
3
51.3
3
75
14
122
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1
4
33
1.29
18991501--18991651
16
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17
70
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59
1
4
33
1.29
18991603--18991649
5
9.2
5
86
13
53
63
0
0
36
0.94
18991505--18991654
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4.3
35
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18
136
59
2
4
34
1.30
18991501--18991649
17
8.8
17
73
19
116
59
2
4
33
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18991599--18991707
16
6.8
16
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20
50
64
2
0
32
1.14
18993409--18993550
71
2.0
73
91
6
236
28
19
17
33
1.95
19005645--19005690
22
2.2
22
84
7
60
56
8
4
30
1.49
19005781--19005843
18
3.7
18
73
23
57
55
3
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34
1.41
19006611--19006667
26
2.2
26
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5
5
12
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1
121
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3
22
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1.68
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5
5.6
5
100
0
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0
0
21
0.75
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1.36
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25
5
5
62
1.41
19011952--19012007
16
3.4
16
82
9
69
37
0
10
51
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344