Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  8  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2939567--2939662
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1.9
159
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18
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20
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
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2996691--2996749
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28
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0
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2.0
24
100
0
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24
0
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46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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25
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2.0
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0
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29
21
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2
0
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50
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1.73
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2.0
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15
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0
60
20
0
0
80
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3177440--3177486
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0
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28
0
11
60
1.32
3241952--3241992
15
2.5
17
75
25
52
65
2
0
31
1.05
3242368--3242408
16
2.5
17
84
11
59
36
0
2
60
1.10
3242369--3242405
14
2.5
15
84
16
51
35
0
2
62
1.10
3242371--3242406
15
2.3
16
85
4
56
33
0
2
63
1.08
3242361--3242417
24
2.5
22
80
8
69
45
0
1
52
1.11
3242380--3242428
24
2.1
24
84
3
64
42
0
0
57
0.99
3242394--3242468
30
2.6
29
81
12
82
44
0
1
54
1.08
3243841--3243897
15
3.8
15
86
6
80
8
28
26
36
1.86
3251365--3251459
42
2.2
43
90
1
147
45
3
2
49
1.29
3255691--3255720
11
2.8
11
95
5
53
16
0
0
83
0.65
3262115--3262156
6
6.8
6
91
5
66
2
11
0
85
0.68
3262115--3262150
13
2.8
13
95
4
65
0
13
0
86
0.58
3262115--3262157
19
2.3
19
95
0
77
2
11
0
86
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3262115--3262157
13
3.4
12
87
9
59
2
11
0
86
0.67
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20
2.0
20
90
9
64
72
0
2
25
0.97
3272901--3273022
42
2.9
41
87
6
174
19
17
31
31
1.95
3279879--3279938
30
2.0
31
93
3
104
46
0
0
53
1.00
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21
2.4
21
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9
63
38
1
1
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1.20
3281012--3281057
21
2.3
20
79
17
51
36
0
2
60
1.09
3282261--3282294
13
2.5
14
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4
52
85
5
2
5
0.83
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84
2.0
84
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0
266
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14
10
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15
2.2
15
100
0
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45
12
6
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468
1.9
469
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4
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41
13
12
32
1.82
3300803--3300847
23
2.0
23
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8
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11
17
6
1.46
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15
2.6
15
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16
53
68
2
5
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1.23
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48
2.0
48
100
0
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26
2.0
25
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4
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30
10
14
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1.9
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30
2
20
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1.63
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22
2.3
23
87
12
74
26
3
9
59
1.46
3315668--3315715
21
2.3
21
86
13
64
29
2
8
60
1.37
3315815--3315856
22
2.0
20
86
9
57
47
2
0
50
1.14
3318890--3318925
13
2.8
14
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16
51
27
25
0
47
1.52
3318877--3318917
18
2.2
19
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12
59
29
24
0
46
1.53
3319040--3319174
39
3.4
38
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8
101
28
28
20
23
1.99
3320749--3320799
5
10.0
5
87
4
75
56
1
0
41
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3325162--3325197
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
3325149--3325189
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
3327022--3327066
5
8.6
5
85
9
63
57
2
0
40
1.11
3330330--3330363
3
11.3
3
87
0
50
0
32
35
32
1.58
3330337--3330365
15
1.9
15
100
0
58
0
31
41
27
1.56
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15
2.7
15
88
0
53
37
2
55
5
1.35
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21
2.0
21
90
0
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0
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2
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2.0
24
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0
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18
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2.0
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1
237
10
21
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3
13.3
3
94
0
71
35
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344