Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  18  of  344  ( 41197 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6390057--6390193
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2.7
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151
30
26
17
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1.97
6405318--6405483
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3.2
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30
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0
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54
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23
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19
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2.1
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32
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19
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1.94
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25
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6462608--6462770
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2.3
70
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2
220
28
25
17
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.0
433
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2
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2
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2.0
29
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2
0
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2.0
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26
2.2
26
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26
2.6
23
80
14
72
33
22
26
17
1.96
6533782--6533838
24
2.3
24
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69
33
21
29
15
1.94
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74
2.6
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174
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22
19
1.94
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3.1
19
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9
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61
6
0
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1.22
6537430--6537483
27
2.0
27
85
7
74
55
5
1
37
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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0
0
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2
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5
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1.41
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2
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155
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3
45
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3
2
40
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5
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51
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2.0
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7
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3
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1.68
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2.6
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84
3
72
13
3
43
39
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6583285--6583341
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2.1
27
100
0
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10
3
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13
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1.9
114
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2
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17
23
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189
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2.3
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13
18
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0
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13
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0
68
39
6
2
51
1.42
6589567--6589637
21
3.4
21
80
0
79
33
18
45
2
1.64
6589861--6589894
14
2.4
14
95
0
59
17
8
20
52
1.71
6589947--6590291
42
8.2
42
82
6
333
26
20
21
31
1.97
6590048--6590291
42
5.9
41
88
1
335
23
21
21
33
1.97
6589962--6590286
126
2.6
126
85
3
422
27
20
21
30
1.98
6590453--6590504
25
2.1
25
96
0
95
40
5
3
50
1.45
6590903--6590938
16
2.3
16
90
4
56
19
0
19
61
1.35
6590994--6591039
25
1.9
24
86
8
67
73
0
2
23
0.94
6591366--6591392
14
1.9
14
100
0
54
37
14
3
44
1.63
6591706--6591770
31
2.1
31
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5
78
47
7
3
41
1.48
6592537--6592594
31
1.9
31
85
3
82
34
8
1
55
1.41
6594572--6594661
46
2.0
44
91
4
144
37
22
18
21
1.94
6595028--6595085
15
3.8
15
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2
89
51
12
0
36
1.39
6605243--6605794
142
3.9
142
92
0
861
27
22
17
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6606942--6606966
3
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3
100
0
50
68
0
32
0
0.90
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69
7.0
69
76
4
351
40
19
20
20
1.92
6629973--6630396
138
3.1
137
78
4
388
39
18
21
20
1.92
6630290--6630396
33
3.1
34
68
20
96
42
19
18
19
1.90
6630007--6630486
207
2.3
208
78
3
504
40
19
20
20
1.92
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12
2.1
12
100
0
50
52
0
8
40
1.31
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3.6
42
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8
191
21
21
24
33
1.97
6636637--6637452
44
18.5
44
75
6
674
29
25
16
28
1.97
6636637--6637452
132
6.2
132
94
0
1382
29
25
16
28
1.97
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266
2.0
266
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0
1026
22
25
18
33
1.97
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12
2.1
12
100
0
50
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0
8
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1.31
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2.2
32
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0
131
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0
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40
1.33
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2
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2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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44
2.4
45
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7
108
32
18
15
34
1.92
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2.0
41
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0
144
30
19
20
28
1.97
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30
2.0
30
86
0
84
58
11
1
28
1.43
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19
2.0
21
90
10
64
76
7
2
12
1.09
6699033--6699079
17
2.7
17
78
15
51
68
2
14
14
1.31
6700097--6700145
15
3.2
16
81
16
52
12
6
44
36
1.67
6700763--6700971
88
2.4
87
80
13
200
33
17
16
32
1.92
6700927--6701119
73
2.6
73
84
9
259
27
22
20
28
1.99
6700937--6701593
241
2.8
238
87
3
930
30
21
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6701174--6701593
73
5.4
76
72
15
281
30
22
18
29
1.97
6701415--6701593
74
2.4
74
82
7
213
28
24
17
29
1.98
6715457--6715505
15
3.2
16
81
16
52
12
6
44
36
1.67
6719757--6719858
53
1.9
54
91
2
170
42
8
15
33
1.78
6727170--6727229
23
2.5
22
81
13
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10
3
10
76
1.12
6729120--6729149
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9.7
3
92
7
51
30
3
0
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1.07
6729161--6729240
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2.5
33
74
8
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25
13
2
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1.48
6731411--6731525
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2.4
46
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7
106
34
20
22
22
1.96
6731553--6731760
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3.9
54
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5
224
35
17
23
23
1.95
6731561--6731759
108
1.8
109
86
3
294
35
17
23
23
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344