Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Percent
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Score
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0
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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26
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
111017263--111017397
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27
1.17
111017582--111017744
11
14.5
11
74
12
109
57
1
18
22
1.49
111017582--111017801
5
40.2
5
75
14
129
56
2
17
23
1.52
111017726--111017801
28
2.7
28
85
0
98
52
2
17
27
1.57
111017842--111017937
20
5.2
18
72
18
81
59
1
10
29
1.37
111027180--111027217
16
2.4
16
90
0
58
31
0
34
34
1.58
111027196--111027290
45
2.1
44
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136
34
5
27
32
1.79
111027452--111027486
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
111027410--111027482
27
2.7
27
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76
52
2
0
45
1.15
111027599--111027633
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
111027371--111027645
147
1.9
149
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1
509
46
3
2
47
1.33
111027719--111027753
18
2.0
17
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52
60
0
0
40
0.97
111027617--111027800
59
3.1
57
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20
151
49
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1
41
1.40
111027829--111027860
16
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0
0
53
1.00
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2.4
120
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2
464
50
5
1
43
1.34
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91
2.3
91
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4
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35
2.0
35
100
0
142
29
8
28
33
1.86
111028648--111028677
12
2.5
12
94
0
51
43
20
23
13
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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19
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21
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23
80
14
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4
0
29
1.12
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1.9
81
86
2
218
38
20
23
17
1.93
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12
2.7
12
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0
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21
0
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1.17
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23
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23
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0
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26
1.75
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2.2
30
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1
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1.41
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0
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0
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1.98
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0
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13
1.83
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26
29
1.95
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0
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5
100
0
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0
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4
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11.0
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32
0
0
67
0.91
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2.8
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33
0
0
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28
0
40
1.57
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100
0
150
29
30
0
40
1.57
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1.9
22
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5
66
58
0
2
39
1.11
111110101--111110132
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2.5
13
100
0
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28
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1.92
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34
100
0
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1.69
111114694--111114729
18
2.0
18
94
0
63
16
36
27
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111117462--111117486
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4.2
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0
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0
0
16
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32
2.1
32
100
0
132
43
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12
30
1.80
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2.4
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7
61
53
0
4
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1.21
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17
2.5
17
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3
77
57
0
0
42
0.99
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2.1
21
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6
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1.52
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1.9
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81
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188
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4
15
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1.9
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1.90
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2.0
21
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5
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1.77
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28
2.1
29
84
9
79
33
5
26
35
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344