Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1
0
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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2.0
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28
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297
25
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0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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12
27
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.13
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15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
102713738--102714054
157
2.0
157
94
2
557
47
5
3
44
1.41
102714106--102714196
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
102714177--102714245
16
4.2
16
96
3
129
37
37
0
24
1.56
102714177--102714245
33
2.1
32
97
2
129
37
37
0
24
1.56
102714628--102714687
28
2.1
29
84
6
79
35
0
1
63
1.05
102718689--102718756
21
3.3
21
80
13
63
16
4
33
45
1.67
102720229--102720273
6
7.5
6
100
0
90
68
0
0
31
0.89
102728346--102728391
23
2.0
24
86
4
67
45
19
10
23
1.82
102728450--102728475
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
102731126--102731309
72
2.6
72
99
0
359
41
23
6
27
1.79
102731310--102731353
3
14.7
3
100
0
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68
0
0
31
0.90
102735571--102735754
72
2.6
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98
0
350
41
23
6
28
1.79
102735755--102735792
3
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100
0
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0
0
31
0.90
102738714--102738779
23
2.9
22
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14
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43
1
1
53
1.19
102738748--102738781
15
2.2
16
89
5
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32
2
0
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1.08
102745234--102745305
36
2.0
36
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10
103
41
4
0
54
1.20
102748578--102748685
40
3.1
34
78
18
123
41
6
37
14
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102748590--102748665
40
1.9
40
97
0
143
38
7
35
18
1.80
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52
2.0
52
98
0
203
33
2
13
50
1.56
102751240--102751302
30
2.1
30
96
0
117
26
3
12
57
1.51
102753024--102753083
18
3.3
19
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13
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51
0
3
45
1.17
102753076--102753120
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2.0
22
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2
2
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1.18
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30
2.1
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0
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0
24
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2.3
155
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503
34
1
20
44
1.59
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2.4
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1
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1.58
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52
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0
14
1.42
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1.9
31
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0
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2.2
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1.70
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62
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160
41
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34
1.77
102786259--102786354
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0
0
50
1.00
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14
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0
0
50
1.00
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0
0
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0
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0
0
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50
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0
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14
1.36
102815119--102815148
6
5.0
6
100
0
60
0
33
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102815113--102815148
18
2.0
18
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0
54
0
38
0
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0.96
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12
3.0
12
91
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40
0
5
54
1.24
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1.9
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772
44
9
12
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1.75
102819891--102819948
28
2.1
28
83
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73
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3
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102819951--102820002
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0
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0
0
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54
17
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20
1.68
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2.0
28
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10
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0
0
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0
0
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29
2.5
29
76
13
69
41
0
4
54
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344