Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  227  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
Entropy
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2.6
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1.9
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.0
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11
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2
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42
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2.0
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429
20
23
14
42
1.88
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19
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52
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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1.14
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2.4
27
83
7
82
55
4
10
29
1.52
75420939--75420980
5
8.6
5
89
10
61
16
0
0
83
0.65
75426111--75426150
16
2.5
16
87
0
53
30
22
7
40
1.81
75426229--75426268
16
2.5
16
83
0
53
30
25
5
40
1.77
75426045--75426401
118
3.0
118
90
0
581
38
22
7
31
1.81
75426347--75426382
16
2.2
16
90
0
54
36
19
0
44
1.51
75430959--75430999
21
1.9
22
90
5
66
39
19
19
21
1.93
75443890--75443963
39
1.9
38
88
2
112
33
13
5
47
1.66
75444981--75445036
22
2.6
21
86
8
76
62
5
19
12
1.49
75451158--75451246
45
2.0
45
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4
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17
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12
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1.84
75454694--75454728
4
8.8
4
100
0
70
25
0
74
0
0.82
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2
25
1.39
75459972--75460039
36
1.9
35
87
3
100
54
1
4
39
1.30
75462485--75462652
51
3.2
51
82
11
210
28
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14
33
1.94
75462526--75462657
58
2.3
58
86
0
192
28
25
14
32
1.94
75465410--75465451
21
2.0
21
90
0
66
33
11
2
52
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75465750--75465826
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4.1
19
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12
77
36
1
1
61
1.13
75470187--75470227
18
2.3
18
95
4
75
19
17
4
58
1.56
75474837--75474865
11
2.7
11
94
5
51
44
0
0
55
0.99
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27
5.2
27
76
16
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35
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17
1.96
75480665--75480780
54
2.1
54
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0
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1.95
75482400--75482507
26
4.2
26
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0
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35
23
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1.85
75487765--75487923
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27
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18
1.96
75487783--75487923
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54
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1.95
75488029--75488102
26
2.8
26
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1.86
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15
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3
20
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1.60
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26
4.2
26
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2
173
36
24
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21
2.0
21
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0
73
34
7
21
36
1.82
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6
12.0
6
72
21
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73
0
21
5
1.01
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21
2.7
21
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15
22
22
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19
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19
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18
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1.65
75499988--75500071
41
2.0
41
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48
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16
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1.9
24
100
0
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26
2.0
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10
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27
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12
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75516685--75516763
39
2.0
39
95
0
140
22
15
22
39
1.91
75520679--75520867
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3.5
54
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2
200
38
19
22
19
1.93
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45
2.0
45
100
0
182
24
27
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75523596--75523639
19
2.2
20
80
4
54
45
6
6
40
1.57
75534645--75534782
40
3.5
40
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1
242
25
26
23
23
2.00
75536293--75536318
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2.0
13
100
0
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7
0
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2.4
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100
0
52
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0
0
38
0.96
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100
0
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0
0
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22
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10
100
0
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2.0
25
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0
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42
16
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1.73
75576667--75576741
37
2.0
37
81
0
87
18
24
14
42
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344