Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86625957--86626013
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1.06
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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25
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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225
21
22
20
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86746524--86747356
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20
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1.96
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21
22
20
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0
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52
0
0
48
1.00
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22
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2
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1.29
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6
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0
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0
0
67
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0
1
52
1.11
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16
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0
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23
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1.75
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24
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26
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0
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0
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1.96
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13
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2.0
43
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56
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33
0
16
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1.50
86784486--86784512
13
2.1
13
100
0
54
37
0
11
51
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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115
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1.93
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16
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5
0
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2.0
32
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0
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0
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2.0
29
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2
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62
0
2
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16
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0
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0
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0
0
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0
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3.2
120
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54
0
0
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2.1
50
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201
27
20
30
21
1.98
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2.3
57
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0
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4.3
16
90
0
102
31
20
5
42
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86855934--86855996
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2.9
22
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34
0
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1.18
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2
0
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0
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21
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0
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17
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22
2.5
22
88
2
69
29
3
29
36
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344