Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  289  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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38
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1.81
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4.4
35
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38
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13
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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19
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23
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1.97
96845278--96845367
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112
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23
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1.97
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2.4
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26
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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16
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1.82
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19
90
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126
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0.98
96911911--96911969
25
2.4
25
91
5
93
8
6
37
47
1.61
96914484--96914531
10
4.6
10
77
10
51
60
2
2
35
1.20
96914482--96914531
22
2.4
21
86
6
66
58
4
2
36
1.29
96920881--96920931
25
2.0
25
92
0
84
33
31
9
25
1.88
96920881--96920939
25
2.4
25
88
0
73
32
28
8
30
1.87
96926873--96926920
14
3.6
13
78
13
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33
0
2
64
1.05
96926873--96926926
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25
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10
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35
0
1
62
1.06
96928782--96928836
20
2.7
21
77
2
58
47
1
0
50
1.11
96928770--96928836
31
2.1
32
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43
1
1
53
1.19
96930735--96930789
21
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21
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32
5
0
61
1.19
96934269--96934301
17
1.9
17
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0
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57
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1.51
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49
2.0
50
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141
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1.83
96936967--96937000
9
3.7
9
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50
2
14
0
82
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1.9
21
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0
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42
25
7
25
1.80
96943427--96943514
37
2.4
37
90
1
142
40
30
12
15
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
4
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56
1.58
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27
2.1
27
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0
105
24
3
19
52
1.61
96961673--96961714
12
3.1
14
74
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23
4
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1.61
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15
2.5
15
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0
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29
8
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37
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2.9
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4
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13
16
24
45
1.82
96969033--96969120
22
3.9
22
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10
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14
15
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1.84
96969007--96969165
47
3.4
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138
13
15
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1.81
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31
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23
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1.93
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22
25
26
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4.3
20
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31
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13
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1.91
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7.5
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30
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22
3
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74
0.96
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2.0
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29
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19
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198
33
12
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44
1.74
96999866--97000017
63
2.4
64
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227
33
12
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1.74
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21
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22
1.86
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0
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15
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0
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4
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4
100
0
74
75
0
0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97009931--97010026
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12
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5
0
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38
5
0
56
1.22
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2.2
22
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44
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12
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12
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5
0
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97024512--97024603
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13.9
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38
5
0
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1.22
97024559--97024687
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3
3
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97041310--97041521
47
4.4
47
80
6
160
28
28
8
34
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344