Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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3.0
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51
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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10
36
1.84
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1.82
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2.0
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4
34
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98324405--98324449
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47
2.5
47
87
5
157
40
21
19
18
1.92
98350055--98350094
6
6.7
6
97
0
71
15
0
2
82
0.77
98350055--98350100
18
2.6
18
89
0
65
13
2
4
80
0.95
98353456--98353563
26
4.2
26
91
0
180
37
24
6
32
1.81
98358449--98358474
12
2.2
12
100
0
52
42
26
7
23
1.81
98359044--98359081
19
2.0
20
84
5
51
63
5
7
23
1.42
98360679--98360738
29
2.1
29
100
0
120
46
26
0
26
1.53
98376376--98376428
26
2.0
26
82
13
65
60
7
15
16
1.57
98383340--98383724
192
2.0
192
98
0
743
26
14
16
43
1.85
98384505--98384558
12
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12
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17
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74
1
16
7
1.14
98384740--98384815
31
2.5
31
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102
23
11
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1.85
98388826--98388903
40
2.0
40
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0
111
35
20
19
24
1.95
98389530--98389581
14
3.6
14
74
5
59
17
1
36
44
1.60
98389530--98389569
21
1.9
21
84
0
53
15
2
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45
1.59
98389530--98389583
15
3.7
15
78
7
67
16
1
37
44
1.59
98389569--98389638
29
2.4
29
76
6
72
20
4
41
34
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98389585--98389625
15
2.7
15
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0
64
19
4
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24
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23
2.3
23
83
6
63
46
5
1
46
1.37
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13
2.9
13
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0
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78
0
0
21
0.74
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7
7.6
7
81
10
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75
1
1
20
0.98
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19
2.2
19
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0
7
24
1.15
98390458--98390501
20
2.2
20
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15
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0
6
25
1.14
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2
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1.84
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0
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0
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68
1.23
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1.9
20
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0
58
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0
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5.1
126
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16
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18
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1.87
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2.3
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2
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8
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40
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1.83
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7
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2.0
25
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0
100
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27
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20
25
11
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3.4
26
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20
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2
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28
1.35
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22
3.3
22
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19
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58
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31
1.37
98404783--98404887
48
2.2
48
98
0
201
59
1
7
31
1.37
98404791--98404869
26
3.2
26
69
20
87
59
2
7
30
1.38
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13
1.9
13
100
0
50
64
0
20
16
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98420745--98420775
12
2.6
12
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0
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0
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6
0.97
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36
48
0
14
1.44
98420963--98420997
9
3.9
9
100
0
70
34
54
0
11
1.37
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35
2.3
35
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130
37
48
0
13
1.42
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3
26.3
3
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30
3
1
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1.18
98421474--98421562
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9.4
9
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1
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1
0
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1.20
98421482--98421562
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3
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1.17
98421762--98421808
12
4.0
12
80
2
51
31
0
6
61
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344