Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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311
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1.8
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25
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1.99
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20
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2.2
131
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15
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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0
0
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21800281--21800460
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16
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2.0
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24
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0
0
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0
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16
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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19
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0
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2.4
23
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149
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2.0
21
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2
0
55
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21892323--21892355
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0
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6.5
8
77
13
59
53
30
0
16
1.43
21925121--21925169
23
2.2
22
88
3
71
53
30
0
16
1.43
21927928--21927970
21
2.0
21
95
0
77
46
32
11
9
1.72
21934044--21934075
9
3.6
9
95
0
55
0
12
46
40
1.42
21934335--21934817
227
2.1
227
83
4
616
29
21
17
31
1.96
21943009--21943051
19
2.2
20
87
4
61
46
4
18
30
1.69
21945754--21945782
13
2.1
14
93
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51
48
3
20
27
1.66
21948765--21948805
14
3.1
14
76
20
52
4
0
36
58
1.20
21955981--21956025
24
1.9
23
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4
63
66
0
0
33
0.92
21972875--21972993
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53
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161
5
26
3
64
1.32
21975526--21975560
5
7.0
5
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0
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0
0
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25
2
1.26
21976313--21976373
32
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32
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0
104
31
0
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1.47
21978076--21978210
35
3.7
37
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22
34
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21989745--21989779
15
2.3
15
90
0
52
8
11
2
77
1.10
21989796--21989820
9
2.8
9
100
0
50
12
0
8
80
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21989883--21989921
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2.5
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43
0
0
56
0.99
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39
2.4
35
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113
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0
0
58
0.98
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21
2.3
21
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3
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42
0
0
57
0.99
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13
4.5
13
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19
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39
0
0
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22
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23
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43
0
0
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0
0
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0
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1.9
149
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4
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12
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14
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0
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2.1
21
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19
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1.22
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1.98
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28
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2.1
21
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4
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23
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5
100
0
112
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0
0
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0.98
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2.2
16
90
5
54
60
0
0
40
0.97
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14
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15
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50
53
0
2
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1.13
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22
2.0
22
90
4
68
45
0
2
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22025387--22025468
21
4.0
21
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43
2
0
53
1.13
22025426--22025462
15
2.4
16
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13
51
40
2
0
56
1.13
22025436--22025488
24
2.3
22
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70
43
3
0
52
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39
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43
3
0
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1.18
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39
0
0
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0.96
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0
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21
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21
20
29
28
1.98
22040832--22040894
19
3.4
19
80
6
67
42
0
4
52
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344