Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67400913--67400987
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26
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3.2
409
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2
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2.8
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5.0
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99
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1.94
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2.2
19
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22
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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13
0
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18
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19
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259
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12
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1.92
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2.5
206
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2.0
16
93
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28
0
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1.16
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21
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2.0
26
100
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2.1
17
94
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22
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46
1.57
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2.1
40
80
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100
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22
21
1.96
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2.4
40
83
3
120
25
14
26
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
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2.2
30
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0
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2.1
14
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51
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1.97
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27
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1.99
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27
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28
20
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1.99
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1.9
119
83
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288
27
27
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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1.93
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2
2
79
0.95
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11
8.8
11
74
10
72
59
3
1
36
1.20
67582958--67583003
23
2.0
24
91
4
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63
2
0
34
1.07
67582950--67583025
31
2.3
31
84
8
89
60
1
1
36
1.13
67582945--67583023
29
2.9
28
76
21
71
60
1
1
36
1.13
67582958--67583026
23
3.0
23
80
18
72
60
1
1
36
1.14
67583048--67583100
17
3.3
17
76
12
58
60
0
5
33
1.20
67583159--67583262
16
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15
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3
1
27
1.20
67583157--67583244
29
3.0
28
74
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79
64
2
2
30
1.18
67583172--67583227
20
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22
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13
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66
1
0
32
1.03
67583199--67583230
12
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14
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6
0
31
1.20
67583068--67583262
61
3.3
58
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137
60
3
6
30
1.38
67583181--67583266
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1
29
1.20
67584787--67585416
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8.1
78
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0
931
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1.97
67585702--67585762
30
2.0
30
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0
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1.94
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55
2.5
55
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1
233
15
28
19
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1.92
67597417--67597459
16
2.7
15
86
10
59
65
0
4
30
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1
5
30
1.25
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16
3.1
16
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13
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0
4
30
1.10
67597421--67597503
38
2.2
39
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2
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3
3
27
1.26
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27
4.0
27
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7
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1.95
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35
1.94
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23
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19
1.90
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23
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43
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19
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0
50
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0
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26
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1.75
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2.0
33
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2.0
80
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37
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23
1.94
67622715--67623093
201
1.9
200
82
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34
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19
30
1.93
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6.7
47
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11
211
26
19
28
25
1.98
67633994--67634304
47
6.6
45
74
15
199
26
18
28
25
1.98
67641433--67641805
189
2.0
189
91
2
615
32
12
24
30
1.92
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46
4.5
45
77
10
192
27
20
30
22
1.98
67641916--67642087
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1.8
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2
272
25
20
32
21
1.97
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47
5.7
46
74
13
172
25
20
29
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67645161--67645276
46
2.5
46
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0
169
23
18
27
30
1.98
67650753--67651069
46
6.8
46
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9
286
22
20
27
29
1.98
67650847--67651015
47
3.6
47
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195
21
19
28
29
1.98
67650807--67651059
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2.7
93
93
0
425
21
19
29
29
1.97
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1.9
40
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29
2.0
29
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2.1
13
100
0
54
22
33
29
14
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344