Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  204  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.96
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Period
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Copy
Number
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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121
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25
0
43
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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31
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1.57
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0
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3
68
80
0
2
16
0.81
68101857--68101897
5
8.0
5
89
5
64
80
0
2
17
0.82
68101857--68101897
16
2.6
16
92
3
66
80
0
2
17
0.82
68104841--68104882
18
2.3
19
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12
52
9
38
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26
1.87
68106693--68106722
15
2.0
15
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0
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33
20
6
40
1.78
68115356--68115415
19
3.0
20
85
9
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25
0
18
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68115439--68115515
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100
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36
1.76
68115439--68115526
20
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20
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1
70
43
7
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35
1.74
68116410--68116459
20
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20
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1.70
68116673--68116701
4
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0
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0
0
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1.00
68118532--68118601
21
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0
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0
0
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0
0
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0.94
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17
5.7
18
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13
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1.82
68118956--68119056
35
2.8
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184
36
13
11
37
1.82
68119472--68119783
82
3.9
77
92
5
441
26
21
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68119549--68119783
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1
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25
21
20
31
1.98
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119
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119
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0
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29
19
17
33
1.95
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44
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28
25
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30
1.97
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23
3.0
22
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0
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0
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0.60
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23
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23
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1
17
0
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1
14
0
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0
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0
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0
0
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17
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13
36
1.84
68127436--68127542
35
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35
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14
13
36
1.84
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7
3.6
7
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0
50
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0
0
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2.2
20
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16
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24
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1.19
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68133062--68133105
24
2.0
24
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27
2
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1.14
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0
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0
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0
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2.7
47
78
15
131
23
30
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68137364--68137392
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0
0
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0
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1.70
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21
2.1
21
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0
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1.61
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5.3
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12
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2.2
17
100
0
74
37
5
5
51
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344