Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  284  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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20
1.97
Indices
Period
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A
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4
100
0
62
77
0
0
22
0.77
95451717--95451820
31
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12
97
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10
20
24
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95452277--95452326
18
2.7
19
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36
0
4
60
1.16
95453079--95453125
26
2.0
25
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0
2
51
1.13
95453444--95453504
16
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14
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70
6
0
22
1.10
95459162--95459338
47
3.8
46
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13
182
21
18
28
31
1.97
95460974--95461067
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1.9
49
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24
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1.80
95463293--95463333
19
2.2
18
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4
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34
17
0
48
1.47
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0
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0
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0.72
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1.86
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28
5.6
27
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19
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95467201--95467429
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1.84
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29
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20
20
30
28
1.97
95477541--95477628
43
2.0
45
82
4
108
22
17
2
57
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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27
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19
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18
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48
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14
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50
0
0
50
1.00
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59
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1.83
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20
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1.86
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21
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0
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1.33
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2.1
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2.1
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10
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2.1
15
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2.0
17
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21
28
28
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14
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0
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1.30
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396
28
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19
36
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95547410--95547730
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1.9
171
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482
28
15
19
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1.93
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3.8
54
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13
20
36
1.90
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1.9
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30
14
19
34
1.92
95547896--95548085
73
2.5
73
83
4
209
32
14
20
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95549613--95549674
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2.1
30
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0
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30
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2.2
20
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10
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1.57
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2.0
22
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2.1
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0
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34
22
20
1.97
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2.9
25
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22
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25
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0
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28
2.2
28
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0
99
31
30
6
31
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344