Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  229  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
1
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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0
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2.0
17
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42
0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.99
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15
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6.6
46
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5
405
29
21
14
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76060202--76060467
52
5.3
52
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35
1.92
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2.3
46
93
0
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20
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1.90
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0
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0
0
34
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2.8
20
81
13
71
56
0
7
36
1.27
76079658--76080195
44
12.2
44
89
0
788
28
26
14
30
1.95
76085376--76085560
40
4.7
40
82
7
209
23
23
27
25
2.00
76085376--76085558
79
2.3
81
84
7
232
24
23
27
25
2.00
76085410--76085583
79
2.2
78
80
10
192
27
21
25
25
2.00
76095017--76095084
23
3.0
23
65
8
57
44
17
4
33
1.69
76095671--76095716
12
3.6
13
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13
51
65
0
2
32
1.05
76095670--76095716
14
3.1
16
76
17
55
63
0
2
34
1.06
76101499--76101687
40
4.7
40
78
4
166
26
26
22
23
2.00
76103053--76103089
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10
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0
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2
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0
81
0.81
76105044--76105114
16
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16
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0
106
36
5
28
29
1.80
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26
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0
3
51
1.19
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3.1
59
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9
170
53
2
1
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1.23
76105426--76105468
21
2.0
21
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2
0
34
1.08
76111074--76111109
18
2.0
18
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0
72
22
16
16
44
1.86
76120561--76120669
58
1.9
58
88
1
166
27
30
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76120570--76120679
29
3.9
28
77
4
112
28
30
15
26
1.96
76128397--76128442
19
2.6
18
82
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58
19
36
21
21
1.95
76129824--76129856
16
2.1
16
100
0
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18
6
27
48
1.71
76130366--76130391
13
2.0
13
100
0
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0
7
61
1.24
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40
5.2
40
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2
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23
23
25
27
2.00
76131759--76131962
79
2.6
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3
351
23
23
25
27
2.00
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28
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0
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28
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1.94
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1.95
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64
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23
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1.96
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2.0
30
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0
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31
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1.84
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2.2
584
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2
1704
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18
24
1.97
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2.0
20
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4
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41
19
0
39
1.52
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26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
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53
2.0
53
92
0
176
27
29
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24
1.98
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2.2
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171
32
17
28
21
1.96
76199138--76199321
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
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3.9
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78
8
224
30
17
27
24
1.97
76203560--76203712
66
2.3
65
85
6
191
33
16
27
21
1.95
76209532--76209562
16
1.9
16
93
0
53
35
16
6
41
1.74
76221859--76222034
56
3.1
56
98
0
334
45
9
22
22
1.80
76223161--76223385
40
5.7
40
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287
24
21
28
25
1.99
76223168--76223418
119
2.1
119
81
7
278
26
20
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76229972--76230078
56
1.9
56
96
0
196
41
19
9
29
1.83
76231209--76231342
46
2.9
46
78
9
164
29
28
20
22
1.98
76236687--76236905
46
4.7
46
78
7
221
30
26
18
24
1.98
76240216--76240273
26
2.2
25
82
11
64
34
10
17
37
1.84
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2.0
36
100
0
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5
24
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2.2
33
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2
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26
22
23
27
1.99
76249441--76249470
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1.9
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6
53
36
16
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1.98
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2.6
12
100
0
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22
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6
1.69
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1.9
16
93
6
53
36
16
0
46
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344