Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  314  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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68
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23
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22
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.96
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320
30
17
20
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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35
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0
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4.0
14
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2
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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80
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10
0.96
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18
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26
1.97
103408156--103408186
11
2.8
11
95
0
53
29
3
48
19
1.64
103409135--103409201
22
3.0
22
97
0
125
49
1
0
49
1.10
103413503--103413581
33
2.4
33
82
4
88
26
5
45
22
1.73
103415627--103415690
22
2.9
22
79
13
69
64
3
0
32
1.10
103415636--103415697
22
2.8
20
72
15
52
62
3
0
33
1.11
103415752--103416193
114
3.9
113
90
3
676
52
15
0
30
1.49
103417897--103417929
9
3.7
9
100
0
66
30
24
0
45
1.53
103420404--103420447
21
2.0
22
87
12
65
31
9
4
54
1.52
103431225--103431351
64
2.0
64
85
3
175
31
18
14
35
1.91
103431423--103431586
88
1.9
88
92
0
274
31
19
20
29
1.97
103431599--103431916
133
2.4
133
88
2
453
30
20
23
25
1.99
103431511--103432387
310
2.8
310
89
1
1355
31
20
22
25
1.98
103431775--103432093
177
1.8
177
92
0
548
30
20
23
26
1.98
103431952--103432227
133
2.1
133
93
1
464
31
20
23
25
1.98
103432041--103432387
177
2.0
178
87
1
500
31
21
22
25
1.98
103436780--103436849
31
2.3
31
80
5
79
28
14
17
40
1.88
103436896--103436929
17
2.0
17
100
0
68
35
11
11
41
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103437097--103437275
89
2.0
89
98
0
349
35
15
10
39
1.80
103438151--103438270
62
1.9
62
89
3
188
30
5
23
40
1.78
103439732--103439778
23
2.0
23
91
0
76
53
0
12
34
1.39
103439883--103439959
24
3.4
22
76
15
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44
0
1
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1.08
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2.0
22
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0
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2
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1.57
103447976--103448020
22
2.0
22
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0
72
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2
15
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1.57
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2.5
172
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2
542
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14
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1.86
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0
50
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0
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2.0
19
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0
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1.36
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2.1
81
81
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190
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9
7
27
1.58
103467272--103467399
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3.2
40
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136
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7
26
1.56
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2.0
28
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0
85
33
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12
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1.91
103472353--103472387
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2.1
17
100
0
70
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1.64
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100
0
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0
34
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2.0
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0
129
17
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11
18
1.74
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3
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0
0
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22
2.5
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43
0
3
52
1.18
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74
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5
900
32
16
19
31
1.94
103499026--103499737
147
4.8
146
88
4
918
32
16
19
31
1.94
103500337--103500405
35
2.0
35
97
0
129
17
52
11
18
1.74
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3
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5
55
36
0
0
63
0.95
103501574--103501631
22
2.6
23
79
12
68
41
0
3
55
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103509460--103509506
24
1.9
24
82
4
58
12
8
4
74
1.19
103509466--103509543
39
1.9
42
82
7
99
12
7
6
73
1.25
103509544--103509575
14
2.2
15
94
5
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18
3
0
78
0.89
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22
3.0
21
76
12
67
43
0
6
50
1.27
103509588--103509745
21
7.1
22
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1
3
55
1.24
103509614--103509727
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3.2
33
84
10
147
38
1
0
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1.14
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0
0
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41
0
0
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0.98
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5.4
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90
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314
25
27
22
24
2.00
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30
1.9
30
82
13
73
47
3
0
49
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344