Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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86
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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A
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(0-2)
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0
13
6
0.93
18609501--18609594
3
31.3
3
76
14
79
36
0
4
59
1.17
18609860--18609935
33
2.3
33
79
6
82
46
2
6
44
1.43
18611166--18611269
45
2.3
45
93
0
172
21
18
19
41
1.91
18611148--18611281
45
2.7
50
76
13
143
20
20
19
39
1.93
18611253--18611287
18
1.9
18
88
0
52
17
25
17
40
1.90
18612282--18612340
31
1.9
31
100
0
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10
27
1.89
18614783--18614816
11
3.0
11
83
8
50
0
11
2
85
0.71
18615663--18615821
44
3.6
44
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13
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28
15
18
37
1.92
18615663--18615859
89
2.2
89
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3
236
27
18
18
35
1.94
18615714--18615905
44
4.3
44
70
13
110
29
21
17
31
1.96
18615910--18616430
88
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88
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3
645
28
22
22
26
1.99
18615936--18616271
44
7.6
44
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9
139
28
21
23
25
1.99
18615915--18616430
264
2.0
264
86
2
732
28
22
22
26
1.99
18616458--18616689
44
5.3
43
64
16
136
23
22
20
34
1.97
18616450--18616864
175
2.4
175
90
3
649
22
23
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18616450--18616915
87
5.3
87
87
2
614
23
22
21
32
1.98
18616803--18616961
44
3.7
43
74
11
155
25
23
22
28
1.99
18617029--18617156
64
2.0
64
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0
238
35
14
18
31
1.91
18618327--18618362
12
2.9
12
95
4
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0
19
0
80
0.71
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30
2.0
30
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0
113
32
22
14
29
1.94
18623629--18623667
3
13.3
3
83
5
53
66
2
2
28
1.18
18626246--18626286
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2.0
22
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9
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1.70
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1.9
39
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1.86
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20
28
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1.97
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42
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11
136
20
19
28
31
1.97
18633842--18633893
26
2.0
26
100
0
104
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7
11
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1.69
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27
2.6
27
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0
79
16
25
16
40
1.90
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31
1.9
30
89
6
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36
13
3
46
1.61
18653022--18653080
23
2.6
23
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2
102
15
22
18
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1.87
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32
2.0
32
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0
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12
25
1.78
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27
2.3
27
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0
115
20
25
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1.93
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219
2.0
219
92
0
715
30
18
20
30
1.96
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33
4.5
33
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5
127
19
15
40
23
1.90
18671268--18671414
66
2.2
66
80
4
172
19
15
40
23
1.90
18673897--18673978
16
5.1
16
76
4
76
20
3
4
70
1.21
18674478--18674515
20
1.9
20
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10
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0
31
0
68
0.90
18675735--18676001
47
5.8
47
74
6
260
24
14
28
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18675805--18675977
87
2.0
87
90
2
276
25
13
27
33
1.93
18677152--18677183
13
2.5
13
95
5
57
6
21
46
25
1.74
18681506--18681625
40
3.0
40
83
8
129
28
14
27
30
1.95
18688872--18688947
40
1.9
40
86
0
107
30
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23
28
1.97
18694803--18694950
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3.4
43
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10
115
31
23
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27
1.97
18721797--18721842
22
2.1
22
87
0
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15
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1.92
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3
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0
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0
0
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0
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15
29
1.94
18746017--18746286
140
1.9
142
91
1
445
17
22
14
45
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344