Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8149989--8150116
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24
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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1.21
8243102--8243152
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20
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2.1
27
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2.8
27
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0
143
26
7
25
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.82
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2.0
197
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29
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13
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2.1
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173
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11
26
25
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8318291--8318417
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25
3
0
70
1.04
8328516--8328580
17
3.8
17
73
15
62
24
4
0
70
1.06
8328569--8328622
22
2.4
22
87
9
74
12
7
1
77
1.05
8328539--8328607
8
8.8
8
71
9
52
18
4
0
76
0.94
8340244--8340298
27
2.0
27
92
0
92
12
20
27
40
1.88
8345570--8345626
21
2.7
21
94
0
96
21
33
24
21
1.97
8361893--8361941
21
2.3
22
82
7
64
20
10
12
57
1.64
8381418--8381450
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
8384363--8384422
6
11.4
5
77
19
52
75
0
3
21
0.95
8388992--8389024
13
2.6
13
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4
50
48
12
0
39
1.40
8389440--8389475
14
2.6
14
90
0
63
55
13
11
19
1.68
8395187--8395291
52
2.0
52
98
0
201
32
17
27
22
1.96
8398258--8398424
46
3.6
46
76
13
180
22
22
26
28
1.99
8398253--8398459
46
4.5
46
73
21
155
24
21
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8398253--8398478
93
2.4
93
90
0
353
24
20
25
29
1.99
8404258--8404479
47
4.7
48
80
9
180
22
21
27
27
1.99
8404307--8404425
47
2.5
47
91
0
193
25
20
26
28
1.99
8405494--8405564
25
2.8
25
89
4
99
26
23
23
25
2.00
8413141--8413192
25
2.1
25
92
3
88
26
19
21
32
1.97
8413148--8413207
25
2.4
25
91
0
93
28
21
26
23
1.99
8413253--8413310
21
2.8
20
77
12
55
36
15
12
36
1.85
8413270--8413302
11
3.1
11
86
8
50
27
15
18
39
1.90
8415662--8415727
28
2.2
29
86
10
98
53
0
16
30
1.44
8415674--8415730
28
2.0
28
100
0
114
50
0
17
31
1.46
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20
2.7
18
80
19
59
72
3
1
21
1.11
8425056--8425098
18
2.4
18
88
0
59
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6
13
9
1.35
8431873--8431906
6
5.7
6
100
0
68
14
0
0
85
0.60
8448380--8448413
15
2.3
15
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10
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67
0
11
20
1.21
8449035--8449072
18
2.1
19
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5
51
47
2
2
47
1.30
8450207--8450501
155
1.9
155
85
1
403
31
18
10
38
1.85
8453510--8453664
42
3.7
42
90
3
233
27
25
14
31
1.95
8453716--8453744
7
4.1
7
100
0
58
13
27
13
44
1.82
8453743--8453829
31
2.8
31
89
0
138
25
27
19
27
1.99
8453805--8453981
50
3.5
50
89
3
266
26
21
15
36
1.93
8458799--8458852
26
2.0
27
89
3
83
29
3
24
42
1.72
8459481--8459516
5
7.2
5
93
0
54
36
19
25
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8465278--8465309
14
2.3
14
94
0
55
9
3
0
87
0.64
8466156--8466196
17
2.4
17
87
4
55
17
9
2
70
1.25
8466216--8466261
21
2.2
21
84
0
56
21
4
6
67
1.32
8466573--8466622
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
8469548--8469582
2
17.5
2
100
0
70
0
48
0
51
1.00
8478719--8478752
14
2.6
13
90
9
52
52
0
2
44
1.16
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38
2.5
38
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10
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2
3
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1.9
70
98
0
261
23
4
17
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1.61
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3
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16
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27
5
3
64
1.31
8490136--8490169
17
1.9
18
94
5
61
29
5
0
64
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344