Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  243  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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96
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2.00
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2.0
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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4.6
48
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159
26
17
30
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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28
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19
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22
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0
31
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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4.8
19
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18
68
41
3
0
55
1.16
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21
78
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4
2
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80903575--80903696
10
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10
70
21
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38
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0
56
1.24
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25
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0
95
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42
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21
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20
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1
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28
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80905521--80905588
20
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19
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1.10
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76
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1.86
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17
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3
31
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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28
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18
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24
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24
1.93
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2.1
19
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2
25
1.13
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2.5
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2
2
29
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3.1
9
100
0
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32
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21
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
38
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0
140
39
15
10
35
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344