Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
481975--482038
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0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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2.2
23
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2
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78
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74
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0
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Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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0
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8
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8
4
51
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
773571--773601
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0
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2.0
20
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15
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57
0
4
38
1.20
811019--811069
23
2.2
23
82
6
59
56
0
1
41
1.10
814252--814295
2
22.0
2
95
0
79
2
0
47
50
1.13
819292--819323
11
2.6
13
90
9
50
28
9
3
59
1.44
830752--831042
142
2.0
143
93
2
496
27
9
18
44
1.81
835761--835791
15
2.1
15
100
0
62
48
12
12
25
1.77
837030--837129
34
3.0
33
78
15
107
52
2
2
44
1.24
841903--841936
17
2.0
17
100
0
68
41
11
5
41
1.66
842021--842067
24
2.0
24
83
8
60
40
0
2
57
1.11
843780--843861
43
1.9
43
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5
130
35
15
2
46
1.60
843783--843874
43
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42
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11
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32
15
3
48
1.61
849384--849448
29
2.2
30
88
2
96
47
4
20
27
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
849753--849934
46
4.0
46
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1
276
37
14
24
23
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856872--856912
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
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25
2.7
22
70
20
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0
0
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24
2.0
26
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8
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51
4
2
42
1.32
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2.2
31
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0
3
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1.16
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0
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0
0
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38
2.1
38
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0
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20
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1.87
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16
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4
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2
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2.0
67
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0
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47
18
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25
1.76
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2.0
20
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0
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0
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0
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0
0
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2.0
31
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8
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0
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2.0
15
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0
0
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19
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3
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4.1
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0
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0
0
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2
21
1.40
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135
3.1
133
81
3
436
38
14
27
19
1.91
926448--926669
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2.3
95
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248
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18
1.91
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1.9
84
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1
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20
18
21
39
1.93
931222--931256
14
2.5
14
85
0
52
77
2
0
20
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
941428--941534
57
1.9
56
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1
142
42
0
5
51
1.32
941485--941563
30
2.6
29
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18
72
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1
7
45
1.40
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24
1.9
23
82
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44
0
24
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1.54
949426--949473
23
2.1
23
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7
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50
6
0
43
1.27
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0
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0
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0
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0
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2.0
42
100
0
172
24
6
32
36
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344