Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  23  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7935438--7935466
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15
100
0
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1.9
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0
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1.69
7937792--7937855
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2
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0
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0
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1.9
19
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0
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2.0
44
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1.9
138
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3.6
20
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20
75
23
14
6
55
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
100
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2.0
21
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2.2
20
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4
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9
30
1.65
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3.1
20
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1.57
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15
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2
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2.0
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0
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2.0
27
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
2.3
18
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8
57
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2
2
17
0.98
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2.1
17
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17
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54
48
0
5
45
1.26
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2.1
34
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21
22
27
1.99
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1.9
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100
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1
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1.9
17
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0
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0
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2
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25
22
16
35
1.94
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10
11
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10
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10
12
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0
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3.4
15
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7
79
0
19
0
80
0.71
8095128--8095175
22
2.1
23
92
3
80
0
18
0
81
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8095118--8095188
23
3.1
22
84
10
81
0
21
0
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0.74
8095119--8095187
15
4.6
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82
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0
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0
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18.0
3
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13
73
0
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0
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4.1
16
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91
0
29
0
70
0.87
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33
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3
94
0
29
0
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0.87
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3.9
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129
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2
23
30
1.67
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2
23
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4.1
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17
16
29
1.92
8096261--8096458
106
1.9
105
90
4
317
33
19
16
30
1.93
8096457--8096490
14
2.5
14
90
4
52
58
2
17
20
1.51
8096736--8096769
16
2.1
16
88
0
50
64
5
11
17
1.45
8096577--8096840
88
3.0
87
82
6
311
39
17
16
26
1.91
8096752--8096912
72
2.2
72
89
4
254
39
16
14
29
1.88
8096787--8097021
122
1.9
126
87
3
352
36
18
14
31
1.90
8096912--8097893
72
13.7
72
94
2
1667
33
18
16
31
1.93
8100089--8100133
14
3.1
15
87
9
67
0
13
2
84
0.72
8100078--8100133
20
2.9
19
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10
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0
10
3
85
0.71
8103836--8103973
17
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10
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10
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1.75
8104171--8104217
20
2.5
19
77
16
53
44
8
17
29
1.78
8104580--8104622
7
5.9
7
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8
59
0
16
0
83
0.64
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22
2.7
24
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17
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1
20
0
77
0.85
8104581--8104624
15
2.9
15
90
6
63
0
18
0
81
0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8104568--8104637
24
2.9
23
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14
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1
20
0
78
0.83
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3
15.0
3
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8
53
0
34
0
65
0.93
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16
3.5
16
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9
62
0
29
0
70
0.88
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30
3.9
30
80
7
132
44
2
22
30
1.66
8105323--8105439
60
2.0
59
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5
164
44
2
22
30
1.66
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14
2.4
15
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4
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25
0
2
71
1.00
8106593--8106632
19
2.1
19
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0
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42
25
5
27
1.75
8107986--8108148
35
4.6
35
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8
179
33
23
11
31
1.90
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31
2.0
31
84
6
81
50
25
3
20
1.64
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21
2.0
21
86
9
59
50
7
2
40
1.43
8119789--8119840
24
2.2
24
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6
70
34
0
7
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1.27
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11
2.7
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0
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0
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0
50
1.00
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2.5
23
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3
3
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1.35
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20
2.0
20
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5
53
35
2
5
57
1.34
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169
1.9
168
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37
7
17
38
1.77
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18
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46
0
0
53
1.00
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2.1
16
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48
0
0
51
1.00
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23
2.5
25
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55
0
10
35
1.34
8137681--8137770
26
3.4
26
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14
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56
1
8
33
1.38
8137735--8137789
23
2.6
20
78
13
56
63
1
3
30
1.22
8137870--8137921
3
17.0
3
78
4
50
57
3
3
34
1.35
8137882--8137921
16
2.6
16
88
4
55
57
5
5
32
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8137935--8137999
33
1.9
34
84
3
87
58
1
7
32
1.36
8137947--8138088
23
6.1
23
68
19
82
57
4
6
31
1.45
8138046--8138088
11
3.9
11
81
0
50
60
4
0
34
1.17
8140631--8140667
19
1.9
19
94
0
65
32
10
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15
2.5
15
95
0
65
32
5
32
29
1.80
8143048--8143244
21
9.6
21
72
6
145
15
21
17
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19
2.7
19
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0
68
13
21
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42
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15
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2.0
40
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2
113
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39
1.80
8150004--8150114
45
2.5
46
89
4
172
22
18
17
41
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344