Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  285  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95587704--95587758
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28
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0
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0
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0
0
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0
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3.2
16
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0
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36
0
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2.1
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2.1
27
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1.50
95631599--95631632
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2.2
21
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2.0
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2.5
29
93
2
119
47
6
8
37
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3
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2.3
23
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1
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2
0
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1.06
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16
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15
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9
60
63
2
2
31
1.18
95687070--95687120
8
6.5
8
84
8
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64
1
1
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1.15
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21
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5
7
32
1.50
95687267--95687331
25
2.8
24
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80
52
6
7
33
1.55
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1.9
35
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3
4
34
1.34
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30
6.8
30
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1
320
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3
47
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1.67
95687974--95688177
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2.3
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1
356
23
3
47
25
1.67
95688924--95688973
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3.6
14
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14
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14
100
0
58
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6
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13
1.45
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4.5
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72
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22
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2.5
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4
52
64
8
8
17
1.47
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3.0
160
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4
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35
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16
26
1.95
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2.8
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82
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247
33
21
14
30
1.93
95689391--95689569
70
2.5
71
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2
234
30
23
15
30
1.95
95689581--95689721
72
2.0
72
92
0
237
38
24
15
21
1.92
95689875--95690211
72
4.5
75
88
4
425
32
19
15
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95689875--95690211
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4.5
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19
15
32
1.93
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2.1
147
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5
426
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15
30
1.92
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3.4
70
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279
33
21
14
30
1.93
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3.5
72
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349
31
21
15
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1.94
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161
1.8
161
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446
33
21
15
29
1.94
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4.5
75
82
9
402
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19
15
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1.93
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2.5
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1.93
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5.7
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1
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1.55
95766050--95766114
33
2.0
33
84
6
87
56
3
4
35
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95766083--95766214
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5.6
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4
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1.34
95766071--95766128
15
3.7
15
73
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1
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36
1.25
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22
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1.66
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1
0
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0
0
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1.00
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39
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8
105
48
0
0
51
1.00
95779862--95779917
29
1.9
29
100
0
112
39
12
7
41
1.70
95779926--95779985
18
3.4
18
83
4
68
33
15
11
40
1.83
95779951--95780036
18
4.9
18
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13
54
38
11
8
41
1.71
95781602--95781635
4
8.0
4
87
12
50
23
2
0
73
0.97
95781602--95781635
9
4.0
8
92
7
50
23
2
0
73
0.97
95781601--95781635
13
2.7
13
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13
54
22
5
0
71
1.07
95784088--95784118
14
2.3
14
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12
6
0
80
0.89
95784597--95784631
18
2.0
18
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14
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22
1.90
95787833--95787978
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40
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0
166
28
15
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1.95
95791734--95791791
30
1.9
31
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1
24
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1.64
95792003--95792034
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0
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50
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4
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26
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28
20
1.99
95792129--95792378
100
2.4
102
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9
337
26
23
28
21
1.99
95799339--95799396
30
1.9
30
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0
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43
3
22
31
1.70
95799734--95799975
50
4.7
50
84
4
279
26
23
28
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95799738--95799983
100
2.4
104
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26
23
28
21
1.99
95807178--95807222
21
2.1
21
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0
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33
17
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1.69
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.0
35
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0
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0
2
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464
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1828
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1.81
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2.7
27
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34
1.80
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18
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0
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3.7
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1.51
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1.52
95831770--95832138
151
2.5
148
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29
1.52
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16
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0
0
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0.98
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2.3
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4
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60
0
0
39
0.97
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2.0
21
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19
12
4
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1.46
95835612--95835649
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2.7
14
91
0
58
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10
0
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1.38
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4.5
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0
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0
0
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20
2.1
20
83
12
52
65
0
6
27
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95865430--95865469
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2.4
16
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12
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7
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1.45
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3
100
0
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0
0
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0.90
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3.3
10
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26
0
2
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1.01
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2.1
27
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9
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60
0
1
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1.07
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4
0
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16
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0
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1.69
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102
1.9
102
85
0
265
39
15
12
32
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344