Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  310  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102262838--102263218
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126
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18
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23
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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5
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2.0
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2
34
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102405772--102405832
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1
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1.26
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0
13
44
1.43
102421656--102421695
20
2.0
20
95
0
71
27
5
0
67
1.11
102423023--102423209
96
1.9
97
91
1
304
29
25
16
28
1.96
102423950--102424019
14
5.2
13
77
19
65
77
2
0
20
0.90
102423954--102424022
6
11.5
6
80
16
65
76
2
0
20
0.91
102423949--102424019
29
2.5
29
84
13
94
77
2
0
19
0.89
102423957--102424015
14
4.1
14
79
14
66
77
3
0
18
0.90
102424748--102424777
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
102424802--102424833
10
3.3
10
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4
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31
6
0
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1.20
102432432--102432479
20
2.4
20
82
6
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64
2
8
25
1.32
102432496--102432532
13
2.8
13
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4
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13
0
43
1.44
102437296--102437333
18
2.1
19
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5
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21
1.66
102441014--102441047
17
2.0
17
94
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0
0
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2
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1.15
102441426--102441462
16
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18
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0
0
18
0.70
102441578--102441781
9
21.6
9
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16
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3
3
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1.32
102441578--102441667
47
1.9
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13
112
26
4
5
63
1.36
102441652--102441735
10
8.5
10
68
24
54
35
3
1
59
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102441642--102441735
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4.8
20
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15
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34
3
2
60
1.24
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9
4.2
9
89
0
58
52
10
5
31
1.58
102447840--102447877
18
2.1
18
100
0
76
52
10
5
31
1.58
102448381--102448424
17
2.6
17
79
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4
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1.50
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0
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1.20
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9
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13
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3
1
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1.13
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0
1
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20
3.9
20
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1
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6
30
54
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2.3
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0
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0
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10
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18
76
38
3
3
55
1.32
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20
7.2
18
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15
100
0
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0
20
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26
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26
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0
152
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24
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1.77
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26
3.2
26
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0
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1.77
102484398--102484427
14
2.2
13
94
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51
76
3
20
0
0.92
102484813--102484869
26
2.2
25
84
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31
3
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1.30
102507193--102507251
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2.0
29
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0
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1.77
102511113--102511153
20
2.0
20
85
0
55
4
26
2
65
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102532401--102532460
26
2.4
25
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3
1
30
1.19
102535491--102535644
52
2.9
52
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4
157
25
16
25
31
1.96
102542878--102543087
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4.2
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128
25
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33
1.93
102556336--102556464
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2.8
46
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0
204
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28
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20
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2.2
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2.0
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0
110
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10
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0
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19
2.3
20
92
3
76
26
10
15
47
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344