Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  101  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27355363--27355427
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2.1
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1.9
19
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1.9
74
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0
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29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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2.0
254
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27
1.95
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27
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1.9
30
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2.0
29
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2.3
26
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1.95
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15
27
1.94
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16
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1.95
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910
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15
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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2.0
30
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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0.83
27474504--27474537
16
2.1
16
89
10
52
79
0
8
11
0.94
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4
100
0
52
26
0
0
73
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22
1.9
21
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24
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60
1.47
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14
2.5
13
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50
8
8
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44
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28
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28
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25
3
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39
1.73
27477742--27477780
17
2.3
17
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58
10
0
30
1.31
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17
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50
35
7
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1.69
27481518--27481552
17
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19
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62
0
0
37
0.95
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2.0
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30
1.80
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0
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0
0
46
1.00
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19
79
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67
0
31
1
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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1.98
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2.3
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0
0
28
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22
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10
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2.3
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2.0
13
100
0
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0
0
84
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27582846--27582876
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16
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0
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0
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2.2
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0
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2
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0
0
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4.0
39
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28
19
28
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345