Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  72  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19624885--19624922
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0
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35
4.6
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185
33
23
10
32
1.89
19644913--19645085
75
2.4
73
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9
210
33
23
10
32
1.89
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102
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.5
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30
18
16
34
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2.6
229
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712
30
19
16
33
1.94
19728827--19729561
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2.3
314
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7
716
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19
16
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.6
22
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33
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
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Score
A
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Entropy
(0-2)
19796628--19796674
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23
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1.93
19803029--19803163
26
5.2
26
96
1
227
33
5
24
37
1.78
19803029--19803163
51
2.6
52
94
1
227
33
5
24
37
1.78
19808745--19808830
26
3.3
26
96
0
163
32
5
25
36
1.80
19811584--19811611
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
19812053--19812413
99
3.5
99
78
11
422
36
6
3
52
1.46
19812362--19812443
43
1.9
43
87
5
121
35
6
4
53
1.47
19812463--19812813
64
5.5
64
95
0
621
47
14
1
36
1.55
19817874--19817902
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
19818314--19818361
21
2.3
21
85
0
60
31
22
43
2
1.65
19818327--19818367
21
1.9
21
85
5
55
26
21
46
4
1.72
19818614--19818672
31
1.9
31
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0
100
16
8
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50
1.72
19818758--19818947
43
4.4
42
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9
170
30
26
15
27
1.96
19818751--19818947
86
2.3
86
84
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252
28
28
15
26
1.96
19820655--19820689
15
2.3
15
90
0
52
68
8
2
20
1.29
19821327--19821406
35
2.3
34
76
8
79
65
7
3
23
1.35
19821180--19821457
3
93.7
3
69
16
136
63
4
5
26
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19824758--19824820
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2.1
30
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0
81
28
4
0
66
1.12
19824780--19824876
39
2.5
39
78
16
96
29
4
2
63
1.24
19824831--19824879
19
2.6
19
90
6
73
34
4
0
61
1.15
19825050--19825097
24
2.0
24
84
8
62
31
6
4
58
1.42
19831046--19831154
26
4.2
26
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1
166
37
22
5
33
1.78
19834646--19834774
7
18.1
7
71
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37
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0
21
1.54
19834899--19834952
7
7.7
7
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0
54
24
0
25
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1.50
19834907--19834991
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21
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1
25
44
1.61
19834918--19835007
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2.0
46
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0
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2
25
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1.67
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19.1
7
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7
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22
0
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36
1.54
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12
2.3
12
100
0
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46
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10
1.78
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2.0
31
87
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92
30
9
4
55
1.52
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
19839893--19839937
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2.1
21
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12
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17
6
2
73
1.15
19841384--19841470
30
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29
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1
0
42
1.07
19841394--19841474
31
2.7
29
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1
0
43
1.07
19842016--19842072
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3.6
16
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80
38
7
26
28
1.82
19842057--19842146
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2.0
46
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4
130
32
5
26
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1.80
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5
5.2
5
100
0
52
38
0
0
61
0.96
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22
3.0
23
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75
25
17
23
32
1.97
19851581--19851651
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37
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5
108
25
12
22
39
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19854310--19854354
22
2.0
22
83
12
56
53
0
2
44
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19854900--19855046
73
2.0
73
100
0
294
42
8
20
28
1.80
19861720--19861752
13
2.5
13
95
0
57
36
39
21
3
1.69
19866132--19866200
33
2.1
33
88
0
102
33
17
5
43
1.73
19867624--19867657
17
1.9
17
88
5
50
64
0
0
35
0.94
19867727--19867771
18
2.5
17
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10
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40
2
2
55
1.24
19868931--19868956
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2.0
13
100
0
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15
0
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12
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4
54
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0
19
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0
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1.81
19877024--19877075
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50
5
19
25
1.69
19880625--19880966
174
2.0
175
89
0
533
34
15
14
35
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345