Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12677023--12677184
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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12746176--12746226
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2.5
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0
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6
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40
23
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.58
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0
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1.47
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2.8
16
82
13
54
39
4
2
53
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12824713--12824794
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3.4
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6
6
56
1.49
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4.6
23
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10
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31
4
5
57
1.44
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2
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1.24
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5
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1.32
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3.8
54
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5
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37
17
14
30
1.90
12831196--12831412
110
2.0
109
86
4
303
37
17
15
30
1.90
12831420--12831821
172
2.4
170
84
10
519
33
20
17
28
1.95
12839004--12839210
15
13.5
14
80
17
209
56
19
6
17
1.63
12839001--12839094
19
5.3
19
68
25
62
60
18
5
15
1.53
12839003--12839210
29
6.8
29
88
10
242
56
19
6
17
1.63
12840325--12840369
17
2.6
17
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28
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8
53
1.62
12841740--12841775
12
3.0
12
87
0
54
25
22
5
47
1.73
12844777--12844882
15
7.4
14
83
7
133
56
16
7
18
1.63
12844777--12844882
29
3.7
28
87
8
151
56
16
7
18
1.63
12844790--12844894
29
3.6
29
78
7
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60
16
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17
1.56
12845997--12846041
17
2.6
17
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74
28
8
8
53
1.62
12852190--12852228
15
2.5
15
87
4
51
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2
2
33
1.23
12852428--12852583
3
51.0
3
83
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188
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1
3
32
1.21
12861482--12861536
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
12861598--12861665
25
2.9
24
82
6
77
58
7
4
29
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12862284--12862352
30
2.3
30
97
0
129
14
7
50
27
1.69
12862986--12863191
87
2.4
87
84
4
245
36
18
14
30
1.91
12863129--12863323
107
1.8
108
89
4
313
40
16
15
27
1.88
12863234--12863588
92
3.9
90
82
6
398
36
18
18
27
1.93
12863391--12863423
14
2.4
14
94
0
57
63
6
12
18
1.48
12863501--12864009
73
6.9
73
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6
579
32
19
16
31
1.94
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146
3.8
146
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8
675
32
19
15
31
1.94
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2.3
219
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755
32
19
16
31
1.94
12864199--12864242
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3.4
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13
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10
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38
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25
1.93
12864220--12864386
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4
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0
15
0
0.61
12868226--12868258
17
1.9
17
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11
50
84
0
15
0
0.61
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1.8
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0
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20
1.98
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3.8
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10
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28
29
21
20
1.98
12872650--12872738
30
3.0
30
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8
101
57
15
16
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15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
12872661--12872738
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
12875681--12875852
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
12875673--12875848
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
12877506--12877672
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2.3
73
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1
253
28
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20
33
1.96
12877653--12877696
13
3.3
13
87
6
70
13
11
6
68
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12877584--12877769
100
1.9
100
87
2
275
25
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19
38
1.92
12877490--12877849
177
2.0
176
86
5
505
26
17
19
36
1.94
12877680--12877891
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8
302
28
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1.95
12878016--12878040
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1.9
13
100
0
50
20
8
0
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12877930--12878096
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1.9
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232
29
14
17
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1.90
12878021--12878410
73
5.3
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9
476
30
16
19
33
1.94
12878021--12878388
146
2.5
146
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612
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66
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28
15
17
37
1.91
12878317--12878734
181
2.3
178
81
8
474
27
16
17
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345