Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr12 103066607 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  31  of  345  ( 41379 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9519536--9519670
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
9519910--9519948
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
9521265--9521316
5
10.0
5
84
15
70
59
0
0
40
0.97
9521904--9521932
11
2.5
12
88
11
51
55
0
13
31
1.39
9521908--9521935
11
2.5
11
100
0
56
60
0
17
21
1.36
9523195--9523242
19
2.5
19
93
0
87
41
16
20
20
1.90
9524932--9525401
131
3.6
131
88
4
646
37
18
18
26
1.93
9524805--9525438
131
4.8
130
83
5
627
35
17
18
28
1.94
9525732--9525782
21
2.5
20
73
20
50
54
13
11
19
1.69
9526971--9527005
17
2.1
16
89
5
52
14
5
5
74
1.19
9529296--9529323
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
9531033--9531072
19
2.1
19
86
9
55
70
0
0
30
0.88
9532783--9532869
43
2.0
43
100
0
174
41
6
6
44
1.58
9554056--9554165
26
4.2
26
91
0
175
33
6
24
35
1.81
9555652--9555704
26
2.0
25
82
13
63
39
22
11
26
1.88
9558794--9558837
22
2.0
23
86
4
63
34
9
18
38
1.82
9559392--9559598
52
4.0
51
81
5
218
25
14
28
31
1.95
9559392--9559597
104
2.0
105
83
2
263
24
15
28
32
1.95
9562558--9562688
3
44.0
3
67
17
60
33
1
6
58
1.32
9562557--9562698
69
2.1
69
100
0
248
33
1
7
57
1.34
9562557--9562688
26
5.5
23
73
19
110
34
1
6
58
1.32
9562573--9562664
17
5.4
17
67
21
57
33
2
5
58
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9562604--9562700
23
4.4
21
72
20
65
32
1
8
57
1.35
9562570--9562714
69
2.1
69
92
3
218
35
2
7
55
1.40
9562837--9562875
13
2.9
13
88
3
51
28
2
0
69
1.02
9562659--9562994
116
2.9
112
72
15
272
27
5
8
57
1.51
9563014--9563076
21
3.0
20
76
19
67
31
3
11
53
1.52
9563078--9563117
19
2.2
19
86
4
55
27
2
0
70
1.01
9563091--9563160
3
24.3
3
75
13
58
27
2
1
68
1.12
9563090--9563158
20
3.5
19
76
7
66
26
2
1
69
1.11
9575436--9575591
73
2.2
72
89
2
240
28
16
21
33
1.95
9575521--9576068
88
6.4
87
75
14
437
28
16
19
35
1.94
9575610--9576068
251
1.8
244
81
10
563
28
16
19
35
1.93
9575840--9576159
173
1.8
176
85
2
457
25
16
19
37
1.93
9575840--9576177
88
3.8
88
82
6
357
26
16
20
37
1.93
9577652--9577717
24
2.8
24
92
0
105
39
6
0
54
1.25
9577652--9577719
12
5.9
12
76
20
74
39
5
0
54
1.25
9577807--9577869
26
2.5
24
80
16
74
34
1
4
58
1.29
9578198--9578255
21
2.7
23
76
17
61
32
3
8
55
1.47
9578198--9578262
23
2.8
23
73
19
71
33
3
9
53
1.48
9578198--9578263
25
3.0
21
70
20
53
33
3
9
54
1.47
9578482--9578512
3
10.0
3
93
6
53
32
0
3
64
1.09
9578593--9578702
31
3.4
33
74
13
95
33
1
9
55
1.42
9587538--9587576
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9590251--9590342
32
2.9
32
77
1
96
43
5
14
36
1.68
9590389--9590470
30
2.7
29
78
10
85
47
3
9
39
1.54
9596526--9596575
3
16.7
3
100
0
100
68
0
32
0
0.90
9606025--9606111
44
2.0
44
81
0
102
40
6
4
48
1.51
9606420--9606476
23
2.7
20
78
15
62
57
8
0
33
1.29
9606657--9606720
32
2.0
32
96
0
119
34
17
3
45
1.64
9615686--9615719
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
9617246--9617295
20
2.5
20
78
12
50
40
4
2
54
1.31
9628475--9628517
18
2.6
18
85
14
65
16
0
4
79
0.90
9628475--9628520
17
2.8
17
84
15
69
15
0
4
80
0.86
9629299--9629323
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
9631283--9631314
16
2.0
16
100
0
64
25
18
12
43
1.85
9633887--9633983
3
32.3
3
95
0
176
64
0
35
0
0.93
9635431--9635538
37
2.9
37
92
0
171
25
31
18
24
1.97
9635679--9636114
48
9.0
48
92
1
701
31
25
6
37
1.82
9635671--9636116
194
2.3
193
93
0
768
31
24
6
36
1.81
9639870--9639920
3
17.0
3
88
8
77
0
31
1
66
1.03
9640276--9640326
20
2.5
20
93
0
84
13
33
35
17
1.89
9641119--9641278
52
3.1
53
77
9
168
30
26
16
26
1.96
9644177--9644231
21
2.6
21
82
0
65
23
29
23
23
1.99
9644545--9644593
16
3.2
16
69
16
50
46
20
0
32
1.51
9644533--9644593
29
2.1
29
96
0
113
45
22
0
31
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9645274--9645365
44
2.1
44
82
8
107
33
22
22
20
1.97
9646399--9646445
2
23.5
2
100
0
94
48
0
0
51
1.00
9646450--9646483
9
3.8
9
92
0
50
52
0
2
44
1.16
9649265--9649303
18
2.1
19
85
4
53
20
5
7
66
1.36
9649264--9649306
19
2.2
20
80
12
54
20
4
6
67
1.33
9650080--9650231
3
50.3
3
70
8
76
30
7
2
58
1.40
9654353--9654417
32
2.0
32
96
0
121
41
7
24
26
1.82
9654307--9654459
78
2.0
78
94
0
270
39
11
24
24
1.89
9654385--9654707
46
7.0
46
89
2
398
41
13
23
21
1.89
9654434--9654506
21
3.3
21
67
14
65
35
10
26
27
1.90
9654988--9655020
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
9656002--9656057
28
2.0
28
100
0
112
28
10
10
50
1.71
9658490--9658850
46
7.8
46
90
0
544
22
24
14
39
1.91
9660984--9661036
11
4.7
11
75
13
54
64
3
0
32
1.12
9660984--9661049
34
2.0
33
82
8
82
59
4
0
36
1.18
9670233--9670721
44
10.7
44
68
9
199
32
18
20
28
1.96
9670371--9670717
140
2.5
141
88
2
529
34
19
19
27
1.95
9672032--9672182
3
49.7
3
82
5
187
32
1
1
63
1.17
9678265--9678316
15
3.1
18
76
18
58
57
0
1
40
1.10
9684285--9684311
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
9693516--9693573
31
1.9
31
82
10
75
50
1
3
44
1.29
9694515--9694585
21
3.4
19
74
14
52
29
4
5
60
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9694529--9694590
21
3.0
21
75
17
58
29
4
6
59
1.43
9694813--9694839
14
1.9
14
100
0
54
29
7
3
59
1.42
9702050--9702078
14
2.1
14
100
0
58
55
0
0
44
0.99
9702074--9702515
147
3.0
148
88
6
656
59
6
6
27
1.47
9708849--9708889
21
1.9
22
90
5
66
2
29
0
68
1.03
9708850--9708892
17
2.6
16
79
13
52
2
30
0
67
1.03
9710282--9710355
31
2.4
31
86
0
94
22
18
13
44
1.85
9710902--9710965
31
2.1
29
85
11
83
39
14
15
31
1.87
9713218--9713283
25
2.6
26
74
11
66
56
4
0
39
1.20
9713968--9714011
19
2.2
20
80
11
56
43
6
9
40
1.63
9723174--9723273
48
2.1
49
96
1
184
37
7
36
20
1.79
9730414--9730510
48
2.0
48
97
0
185
16
12
17
53
1.72
9732423--9732454
16
1.9
17
93
6
57
37
0
0
62
0.95
9741122--9741236
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
9741122--9741255
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
9747063--9747177
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
9747063--9747196
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
9748538--9748624
39
2.2
39
91
0
138
21
21
29
26
1.99
9758610--9758693
43
2.0
43
93
6
147
51
2
2
44
1.27
9761455--9761486
16
2.0
17
88
11
50
31
15
0
53
1.43
9761767--9761798
16
2.0
16
100
0
64
43
6
18
31
1.75
9777383--9777559
50
3.5
50
86
2
248
35
16
21
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9777537--9777738
31
6.5
31
88
0
287
29
18
25
26
1.98
9777744--9777772
7
4.1
7
100
0
58
44
13
27
13
1.82
9779677--9779748
21
3.5
21
84
1
83
13
20
27
37
1.91
9780852--9780977
47
2.7
48
86
2
166
29
15
25
29
1.96
9783508--9783555
19
2.6
18
75
15
53
50
2
0
47
1.12
9786158--9786192
15
2.2
16
90
5
54
51
0
2
45
1.16
9786195--9786262
32
2.0
32
86
8
91
33
1
16
48
1.55
9789430--9789488
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
9789459--9789518
26
2.4
24
83
8
75
28
0
3
68
1.05
9789674--9789712
11
3.6
11
86
6
62
10
56
33
0
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345