Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  102  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27592982--27593151
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16
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27
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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20
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5
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0
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2.2
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58
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0
22
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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25
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59
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2
16
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.97
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18
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0
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18
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0
370
22
22
19
35
1.96
27751828--27752124
131
2.3
131
82
3
366
21
22
20
35
1.96
27751828--27752124
44
6.8
44
76
5
183
21
22
20
35
1.96
27758275--27758458
40
4.6
40
80
4
165
28
22
25
23
1.99
27763984--27764030
19
2.5
19
86
6
60
42
8
19
29
1.80
27766859--27766941
3
27.3
3
73
20
59
65
1
3
30
1.17
27766859--27766938
12
6.8
12
75
12
76
65
1
3
30
1.18
27767547--27767586
17
2.4
17
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0
71
22
12
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30
1.91
27768675--27768726
24
2.2
24
82
0
59
32
7
9
50
1.64
27770053--27770092
20
2.1
19
95
4
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45
7
0
47
1.31
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10
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7
0
46
1.31
27771745--27771791
22
2.1
23
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29
0
4
65
1.11
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32
0
1
65
1.04
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37
2.0
37
100
0
150
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21
1.91
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158
2.0
158
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1.8
81
86
0
217
32
26
16
24
1.96
27788211--27788356
40
3.6
40
85
1
184
32
26
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27799516--27799549
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2.1
16
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0
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5
32
29
1.81
27810751--27810807
30
1.9
30
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0
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14
29
29
26
1.95
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20
3.0
20
78
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25
1
3
70
1.12
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25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
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20
3.0
20
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0
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20
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1.86
27818531--27818585
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5.4
11
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20
30
1.87
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24
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24
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28
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22
26
1.99
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47
3.0
47
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207
28
22
22
26
1.99
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71
2.0
72
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220
29
22
22
26
1.99
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3.1
31
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22
23
1.92
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25
1.9
25
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1.96
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20
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20
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11
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16
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38
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20
30
1.87
27826718--27826860
24
6.0
24
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4
209
28
22
22
26
1.99
27826718--27826860
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
27826718--27826861
71
2.0
72
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220
29
22
22
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1.99
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31
3.1
31
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0
181
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15
22
23
1.92
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1.9
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190
33
17
28
20
1.95
27853490--27853518
14
2.1
14
100
0
58
27
13
6
51
1.66
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26
2.2
26
93
0
96
35
33
7
24
1.82
27870156--27870336
49
3.7
49
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231
27
18
23
29
1.98
27870158--27870344
99
1.9
100
92
1
313
27
19
22
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27877531--27877612
37
2.2
37
100
0
164
35
24
2
37
1.69
27878352--27878416
30
2.2
29
91
2
103
36
24
13
24
1.92
27898183--27898208
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2.2
12
100
0
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53
30
7
7
1.57
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15
2.8
15
100
0
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0
7
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0
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2.3
76
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233
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15
16
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4.9
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336
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1.94
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12.3
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74
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636
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16
19
33
1.94
27913770--27915117
158
8.5
157
82
9
1458
31
16
19
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345