Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  309  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.4
37
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164
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18
32
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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33
97
2
137
40
0
15
44
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93145810--93145861
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19
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93155745--93155901
5
31.0
5
71
21
82
20
3
18
57
1.53
93155743--93155925
9
19.9
9
71
20
96
21
3
18
57
1.54
93155713--93155928
49
4.3
48
76
12
145
19
3
18
57
1.55
93155799--93155892
26
3.2
28
72
24
93
19
2
19
59
1.48
93155746--93155926
61
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60
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5
249
21
3
17
57
1.54
93162418--93162460
19
2.3
18
84
15
52
37
2
9
51
1.47
93162616--93162645
14
2.1
14
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0
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20
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30
1.77
93162637--93162677
20
1.9
21
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14
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34
12
4
48
1.62
93163007--93163042
3
12.0
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100
0
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0
0
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0
0
34
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43
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20
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1.98
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1.43
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20
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2.1
15
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59
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18
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48
2
4
46
1.32
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40
2.3
40
90
5
141
18
22
26
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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22
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3
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1.33
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2
20.5
2
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0
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4
0
46
1.23
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1.9
75
100
0
284
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12
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145
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501
30
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33
1.94
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72
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15
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28
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53
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1.9
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1.93
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27
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23
2.2
23
85
0
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70
23
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1.14
93195796--93195846
24
2.2
24
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23
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1.14
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2
17.0
2
94
5
61
48
2
0
48
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93205248--93205282
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1.9
18
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0
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71
0
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2.3
29
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2
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34
1.20
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0
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2.0
26
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0
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5
0
43
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345