Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  111  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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74
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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83
8
107
36
1
4
57
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30027498--30027602
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10.4
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35
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2
7
42
1.43
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312
1.9
314
86
3
845
28
15
15
40
1.88
30038582--30038607
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
30043192--30043249
26
2.2
26
93
0
98
41
20
15
22
1.90
30043661--30043693
13
2.5
13
100
0
66
42
18
6
33
1.75
30047480--30047537
30
1.9
31
85
3
82
32
8
20
37
1.83
30047499--30047555
20
2.8
20
91
0
96
35
8
21
35
1.84
30047603--30047672
25
2.8
25
97
0
131
24
25
24
25
2.00
30047603--30047708
25
4.2
24
83
10
115
29
21
23
25
1.99
30047891--30047967
31
2.5
31
86
0
100
33
22
23
20
1.97
30055610--30055660
19
2.6
19
81
6
57
39
11
13
35
1.82
30055599--30055646
15
2.7
19
84
15
68
37
12
16
33
1.86
30055693--30055762
25
2.8
25
97
0
131
24
25
24
25
2.00
30055693--30055798
25
4.2
24
83
10
115
29
21
23
25
1.99
30055983--30056065
31
2.7
31
86
1
114
33
19
25
21
1.97
30058479--30058626
25
6.0
25
84
2
165
31
19
27
20
1.97
30062533--30062817
136
2.1
136
97
0
543
24
18
25
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30066565--30066674
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
30068156--30068205
26
1.9
26
84
8
66
38
22
16
24
1.93
30072491--30072600
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
30076650--30076688
19
2.1
19
90
4
62
56
5
0
38
1.22
30079084--30079286
45
4.5
45
86
0
271
23
20
18
37
1.94
30079168--30079306
45
3.1
45
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15
117
25
21
17
35
1.95
30079275--30079381
46
2.4
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84
3
142
20
17
15
45
1.85
30081577--30081680
23
4.3
24
84
10
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24
21
20
34
1.96
30081577--30081680
47
2.2
49
83
13
128
24
21
20
34
1.96
30103098--30103152
16
3.4
16
94
0
92
36
5
25
32
1.79
30112248--30112460
92
2.3
93
89
1
322
42
15
23
19
1.88
30112238--30112448
46
4.6
46
88
2
291
42
13
23
19
1.87
30127759--30127802
23
1.9
23
90
0
70
61
4
0
34
1.16
30133916--30133968
28
1.9
28
81
11
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56
1
1
39
1.21
30142149--30142222
18
4.3
17
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13
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8
10
2
78
1.06
30142156--30142228
30
2.5
28
85
8
101
9
10
1
78
1.04
30142254--30142322
10
6.9
9
74
19
57
13
2
4
79
0.99
30142542--30142582
20
2.0
21
86
13
59
24
7
0
68
1.15
30142681--30142755
30
2.5
30
97
0
141
30
26
21
21
1.98
30144373--30144460
21
4.1
21
75
13
56
57
3
1
37
1.23
30144443--30144476
13
2.7
13
90
4
52
73
0
0
26
0.83
30144474--30144531
25
2.2
27
87
6
84
43
1
5
50
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30144640--30144678
16
2.5
16
87
4
53
82
7
2
7
0.94
30144676--30144722
12
3.5
13
83
13
60
42
0
0
57
0.98
30144675--30144722
7
7.1
7
84
15
66
43
0
0
56
0.99
30144913--30145024
34
3.2
37
77
10
126
60
3
1
33
1.24
30144913--30145033
37
3.5
33
80
9
111
60
3
2
33
1.26
30145077--30145129
24
2.2
23
83
9
70
73
1
3
20
1.08
30145065--30145137
37
2.1
34
87
7
101
72
1
4
21
1.09
30145252--30145300
10
4.8
10
80
5
53
67
0
6
26
1.14
30145252--30145300
21
2.3
22
82
10
66
67
0
6
26
1.14
30145352--30145378
14
1.9
14
100
0
54
55
0
0
44
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345