Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11125194--11125495
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11125194--11125530
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12.0
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1.61
11125194--11125530
114
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315
22
17
5
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1.61
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2.4
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0
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82
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301
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13
21
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0
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0
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20
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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1.11
11149952--11150020
27
2.5
28
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11
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1.11
11150002--11150041
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24
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0
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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13.8
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15
29
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2.1
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14
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1.95
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2
312
21
30
16
32
1.95
11212390--11213247
132
6.5
132
78
12
727
22
30
16
29
1.96
11213209--11213432
88
2.6
88
92
2
362
28
28
16
26
1.97
11213240--11213377
41
3.2
41
64
22
102
31
26
16
24
1.96
11213277--11213424
47
3.3
46
65
27
127
30
29
16
23
1.97
11213542--11213664
61
2.0
64
87
7
182
39
12
15
33
1.84
11221768--11221828
30
2.0
30
87
0
86
31
22
6
39
1.80
11230330--11230369
9
4.7
9
87
9
57
5
7
0
87
0.66
11233116--11233167
25
2.0
25
85
10
70
28
13
3
53
1.57
11236479--11236518
15
2.7
15
84
11
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45
2
7
45
1.45
11236686--11236730
2
22.5
2
95
0
81
48
0
2
48
1.13
11237635--11237670
2
18.5
2
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56
50
0
0
50
1.00
11237670--11237699
2
15.0
2
100
0
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0
0
50
50
1.00
11237855--11237911
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
11237851--11237909
30
2.0
28
93
6
100
32
0
11
55
1.36
11238295--11238344
21
2.3
21
89
6
73
14
26
26
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11238306--11238369
21
3.0
21
86
0
83
14
23
26
35
1.93
11240878--11240923
19
2.4
19
82
7
58
26
26
2
45
1.65
11249036--11249533
44
11.5
44
68
12
149
27
19
22
30
1.98
11249096--11249447
171
2.1
171
93
1
598
28
17
23
29
1.97
11249119--11249412
89
3.4
89
70
11
293
28
18
23
28
1.98
11249251--11249592
133
2.6
132
89
3
498
28
18
22
30
1.97
11249288--11249536
44
5.6
45
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7
177
27
20
23
29
1.99
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41
2.0
41
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0
135
33
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34
1.89
11251378--11251426
25
2.0
25
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28
10
4
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1.50
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3
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0
50
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5
0
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1.20
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7
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100
0
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0
0
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3.5
50
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3
293
35
16
23
25
1.95
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31
4.8
31
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8
181
27
19
27
25
1.99
11257171--11257282
40
2.7
42
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15
25
27
1.95
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4
6.5
4
100
0
52
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0
0
23
0.78
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23
1.9
23
100
0
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22
13
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24
1.9
24
86
0
65
78
8
2
10
1.05
11267578--11267611
17
2.0
17
88
0
50
79
5
0
14
0.91
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27
4.1
26
88
5
141
36
23
23
17
1.95
11271872--11271982
54
2.1
54
87
3
161
36
23
23
17
1.95
11273587--11273669
26
3.2
26
94
0
148
36
25
6
32
1.80
11280171--11280240
6
11.5
6
83
8
88
45
1
0
52
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11283571--11283610
20
2.0
21
85
5
55
22
2
2
72
1.09
11288421--11288596
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
11288417--11288588
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
11291539--11291607
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
11291530--11291617
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
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1.66
11294001--11294176
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
11293997--11294168
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
11297123--11297191
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4.6
15
83
0
84
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17
13
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1.64
11297114--11297201
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
11299587--11299715
46
2.8
46
96
0
231
19
22
29
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345