Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  99  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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12
2.2
12
100
0
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26861239--26861288
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2.3
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1
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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18
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2.5
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4
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1.30
26918665--26918785
25
5.1
24
70
17
92
58
2
4
34
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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22
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1
0
66
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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60
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2
10
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1.37
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230
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22
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1.96
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17
23
32
1.96
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2.1
455
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5
1248
26
17
22
33
1.96
26992411--26992934
75
6.9
75
80
8
451
28
17
22
31
1.97
26992836--26993160
178
1.8
181
82
7
421
28
15
18
37
1.91
26992944--26993115
92
1.9
94
86
2
249
27
16
18
37
1.92
26993089--26993126
15
2.7
14
80
11
51
26
7
2
63
1.35
26992944--26993160
92
2.4
89
82
5
238
28
15
19
36
1.92
26994316--26994375
22
2.7
22
97
0
111
31
6
5
56
1.47
26996673--26997243
44
13.0
44
84
2
707
28
14
30
26
1.95
26999937--27000308
132
2.8
129
80
5
372
29
19
18
33
1.95
27001273--27001439
85
2.0
85
80
2
192
41
19
11
26
1.87
27012256--27012384
50
2.5
51
90
5
199
35
16
22
25
1.94
27012360--27012539
31
5.8
31
89
2
272
25
19
28
26
1.99
27012564--27012686
46
2.7
46
83
3
149
28
16
26
29
1.97
27012657--27012771
42
2.7
43
86
4
162
32
13
26
27
1.94
27013722--27013806
13
6.2
14
68
14
61
14
35
35
15
1.87
27013739--27013806
28
2.4
28
95
0
127
14
35
36
13
1.85
27015528--27015674
40
3.7
40
77
3
170
30
15
22
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27017946--27017974
6
4.8
6
100
0
58
51
0
31
17
1.45
27022453--27022478
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
27025008--27025048
14
3.0
14
85
3
57
68
4
2
24
1.22
27025012--27025073
22
2.8
22
80
4
63
62
11
6
19
1.49
27026229--27026265
6
6.0
6
90
6
56
51
0
0
48
1.00
27044453--27044511
17
3.4
17
77
13
59
35
0
5
59
1.20
27050394--27050467
25
3.0
24
73
15
69
28
21
16
33
1.95
27052400--27052434
13
2.6
13
90
4
52
8
20
40
31
1.82
27052925--27053060
26
5.2
26
96
0
236
33
5
25
36
1.80
27058676--27058783
51
2.1
51
98
0
207
34
4
25
36
1.77
27058676--27058783
25
4.2
25
92
3
180
34
4
25
36
1.77
27060252--27060303
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
27063522--27063688
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
27063517--27063688
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
27071019--27071185
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
27071014--27071185
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
27073875--27073934
10
6.0
10
84
11
79
68
1
8
21
1.25
27074485--27074524
21
2.0
20
90
5
62
17
27
40
15
1.89
27077744--27077783
5
8.0
5
100
0
80
60
0
0
40
0.97
27082333--27082366
18
1.9
18
88
5
52
29
0
5
64
1.17
27082197--27082989
421
1.9
426
85
6
1110
43
10
12
33
1.76
27083888--27083921
14
2.2
16
90
10
54
44
2
0
52
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27088074--27088106
15
2.1
16
88
5
50
54
6
0
39
1.25
27088706--27088758
27
2.0
27
85
3
72
43
13
5
37
1.67
27092188--27092214
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
27097189--27097248
11
5.5
11
72
7
50
21
5
5
68
1.29
27098831--27098864
2
17.0
2
87
0
50
50
5
0
44
1.26
27100705--27100742
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
27110743--27110988
135
1.8
134
82
3
316
34
9
10
45
1.72
27122150--27122209
30
2.0
30
100
0
120
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13
20
20
1.83
27125635--27125685
25
2.0
25
100
0
102
49
11
15
23
1.78
27126914--27126978
29
2.2
30
83
10
89
53
10
12
23
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345